نقش كروموزوم‎هاي 1 و 6 در كنترل ژنتيكي صفات زراعي برنج

Role of chromosomes 1 and 6 in the genetic control of agronomical traits in rice

به منظور مكان يابي QTLهاي مرتبط با صفات زراعي در برنج، يك جمعيت F2:3 حاصل از تلاقي دو رقم اينديكا شاه پسند و IR28 براي مكان يابي صفات زراعي در برنج استفاده شد. نقشه پيوستگي حاصل از 33 نشانگر ريز ماهواره حدود 336 سانتي مورگان از نقشه برنج را روي كروموزوم هاي يك و شش پوشش داد. جمعيت نقشه يابي در مزرعه تحقيقاتي دانشگاه گنبد كاووس پرورش داده شد. پنج QTL، براي بيوماس (دو QTL) و شاخص برداشت (سه QTL) تشخيص داده شد. آلل هاي افزايش دهنده صفات براي كليه QTL هاي رديابي شده جز qHI-1a شناسايي شد. QTL هاي مرتبط با شاخص برداشت با اثر افزايشي از والد IR28 روي كروموزوم هاي 1 (qHI-1b) و 6 (qHI-6) تشخيص داده شد. تعداد دانه پر، ارتفاع گياه، طول خوشه، تعداد خوشه، وزن دانه و وزن خوشه مكان يابي شد. سه QTL براي تعداد دانه پر روي كروموزوم‎ 1 (دو QTL) و كروموزوم 6 (يك QTL) رديابي شد. هم‎چنين سه QTL روي كروموزوم هاي 1 و 6 براي تعداد خوشه، يك QTL براي ارتفاع گياه، وزن خوشه و طول خوشه روي كروموزوم 6 و براي وزن دانه روي كروموزوم 1 رديابي شدند. آلل هاي IR28 در qFG-1a، qFG-1b و qFG-6 تعداد دانه پر را افزايش داد. از بين QTL هاي رديابي شده، سه QTL به ترتيب براي تعداد دانه پر(qFG-1a)، طول خوشه (qLP-6) و وزن دانه (qWG-1) بزرگ اثر تشخيص داده شدند و به‎ترتيب 33/14، 45/12 و 99/11 درصد از تغييرات فنوتيپي را توجيه نمودند. نتايج نشان داد كه QTL هاي جديد رديابي شده نقش مهمي در رشد جمعيت برنج داشتند و ابزار مهمي براي اصلاح صفات زراعي محسوب مي شوند.

In order to mapping of QTLs related to agronomical traits, an F2:3 population derived from the cross between Shahpasand (indica) and IR28 (indica) was used to mapping agronomic traits in rice. The linkage map constructed by 33 simple sequence repeat (SSR) molecular markers covered a total of about 336 cM rice chromosomes 1 and 6. Mapping population was grown in Gonbad Kavous University. Five QTLs, for biomass (Two QTLs) and harvest index (Three QTLs) were identified. The allele from IR28 parent increased biomass production. The additive effects of all alleles, except the alleles of qHI-1a increased measured traits in the plant. The QTLs related to harvest index were located on chromosomes 1 and 6 where the allele from IR28 at qHI-1b and qHI-6 increased harvest index. Number of filled grains, plant height, and panicle length, number of panicle, grain weight, and panicle weight were mapped. Three QTLs for number of filled grain were detected on chromosome 1(two QTLs) and choromosome 6 (1 QTL). Indeed, three QTLs on chromosomes 1 and 6 for the number of panicles, one QTL for the plant height (chromosome 6), one QTL for the panicle length and grain weight (chromosome 1) were identified. IR28 alleles in qFG-1a, qFG-1b and qFG-6 increased number of filled grains. Among these QTLs, the three major QTLs with very large effects, i.e. qFG-1a for number of filled grain, qLP-6 for panicle length and qWG-1 for grain weight explained 14.33, 12.45 and 11.99% of the total phenotypic variances, respectively. The results reinforced the idea that, new QTLs of this study could play an important role in the developing of rice populations