بررسي كارآمدي روش هاي ديسك ديفيوژن، آگاراسكرين و E-test در مقايسه با Real-time PCR براي تشخيص استافيلوكوك هاي كواگولاز منفي مقاوم به متي‎سيلين جدا شده از نمونه هاي كلينيكي بيمارستان هاي آموزشي شهركرد

Comparison of the performance of Disk diffusion, Agar screening and E-test methods with Real-time PCR for the detection of methicillin resistant coagulase negative Staphylococcus strains isolated from clinical samples of Shahrekord university hospitals,

زمينه: استافيلوكوك هاي كواگولاز منفي (CoNS) يكي از عوامل عفونت هاي بيمارستاني هستند. هدف از اين مطالعه مقايسه كارآمدي روش‎هاي ديسك ديفيوژن، آگار اسكرين و E-test در مقايسه با وجود ژنmecA است كه به روش Real-time PCR در ايزوله‎هاي كلينيكي استافيلوكوك كواگولاز منفي مقاومت به متي سيلين، به عنوان استاندارد طلايي تعيين شد. مواد و روش‌ها: 88 ايزوله استافيلوكوك كواگولاز منفي از نمونه هاي باليني بيمارستان هاي آموزشي شهركرد جدا شدند. با روش‎هاي ديسك ديفيوژن، آگار اسكرين، E-test سويه هاي مقاوم به متي سيلين شناسايي شده و وجود ژن mecA به-روش Real-time PCR تعيين گرديد. مقايسه نتايج روش هاي انجام شده با نتايج Real-time PCR توسط آزمون كاي مربع و آزمون دقيق فيشر انجام گرديد. يافته‌ها: از بين 88 ايزوله استافيلوكوك كواگولاز منفي، 46 مورد (3/52 درصد) حامل ژن mecA بودند و 42 مورد (7/47 درصد) فاقد اين ژن بودند. نتايج همه روش هاي استفاده شده ارتباط معني داري با Real-time PCR نشان دادند. E-test داراي حساسيت، اختصاصيت 100 درصد، اگزاسيلين آگار اسكرين (6/0 ميكروگرم بر ميلي ليتر) به ترتيب حساسيت و اختصاصيت 96 درصد و 98 درصد، حساسيت و اختصاصيت ديسك ديفيوژن به ترتيب 91 درصد و 90 درصد بود. نتيجه گيري: بر طبق مطالعه حاضر، بهترين روش فنوتيپي E-test مي باشد كه استفاده از آن توصيه مي گردد. در صورت وجود محدوديت هاي اقتصادي، روش آگاراسكرين (6/0 ميكروگرم بر ميلي ليتر) كه در تشخيص مقاومت به متي سيلين در سويه هاي استافيلوكوك گوآگولاز منفي از نظر صحت و مقرون به صرفه بودن روش مناسبي مي باشد، نيز قابل پيشنهاد است.

Background: Coagulase Negative staphylococci (CoNS) are nosocomial pathogens. The main objective of the study was to compare the performance of disk diffusion, E-test and agar screening methods with Real-time PCR technique for detection of methicillin resistance in coagulase negative staphylococci (MRCoNS), using Taqman® Real-time PCR for mecA as the “gold standard” comparison assay. Methods: 88 coagulase negative Staphylococcus isolates were identified out of 284 Staphylococcus isolates collected from Hajar and Kashani hospitals-shahrekod, Iran. Methicillin resistance strains were identified by several methods: Disk diffusion, Agar screening, E-test and Real-time PCR. The results of the tested methods were compared with those of the Real-time PCR by Chi square or Fisher’s exact tests. Results: Of the 88 coagulase negative Staphylococcus isolates tested, 46 isolates (52.3%) were mecA-positive and 42 isolates (47.7%) were mecA-negative. The results of all the tested methods had a statistically significant agreement with those of Real-time PCR. The E-test was 100% sensitive and specific for mecA presence. The sensitivity and specificity of oxacillin agar screen (6.0 ?g/ml) method were 96% and 98%, respectively and the sensitivity and specificity of oxacillin Disk diffusion method were 91% and 90%, respectively. Conclusion: In the present study, E-test is proposed as the best phenotypic method. In case economic issue matters, the oxacillin agar screening method (6.0 ?g/ml), which is suitable for the detection of MRCoNS due to its accuracy and low cost, is recommended.