بررسي تنوع ژنتيكي قارچ Monosporascus cannonballus عامل بيماري پوسيدگي ريشه و زوال خربزه در ايران با استفاده از نشانگر rep-PCR‌

STUDY OF THE GENETIC DIVERSITY OF Monosporascuse cannonballus ISOLATES CAUSAL AGENT OF ROOT ROT AND VINE DECLINE OF MUSKMELON IN IRAN USING REP-PCR MARKER

بيماري پوسيدگي ريشه و زوال خربزه ناشي از قارچ Monosporascus cannonballus يكي از مهم‌ترين بيماري‌هاي قارچي خربزه در ايران مي?باشد. تاكنون اطلاعي از ساختار ژنتيكي جمعيت‌هاي قارچ عامل بيماري در ايران در دسـت نمي?باشد. در اين بررسي، جدايه‌هاي‌ M. cannonballus از بوته‌هاي آلوده طالبي، خربزه و هندوانه از مناطق مختلف كشور مانند اصفهان، يزد، تهران، فارس، سمنان، مركزي، خراسان رضوي، قزوين، سيستان و بلوچستان جمع‌آوري گرديدند. تنوع ژنتيكي50 جدايه با استفاده از نشانگرrep-PCR و آغازگر‌هايBOX و ERIC با تكثير قطعاتي از DNA تعيين گرديد. اندازه قطعات تكثير شده بين bp100 تا bp1500در نوسان بود. ميانگين تنوع ژنتيكي در بين جدايه?هاي اين بيمارگر در كشور 32/0 محاسبه شد. تجزيه خوشه?اي با استفاده از ضريب تشابه دايس و روش UPGMA وجود 100 درصد تشابه را بين برخي از جدايه?ها كه از مناطق مختلف جمع?آوري شده بودند نشان داد. از نظر ويژگي‌هاي مورفولوژيكي نظير شكل و رنگ پرگنه جدايه?ها در محيط كشت و تنوع ژنتيكي مولكولي آنها ارتباط وجود داشت به طوري‌كه بر اين اساس و در سطح تشابه 80 درصد جدايه?ها در سه گروه مختلف قرار گرفتند. در سطح تشابه70 درصد جدايه‌ها براساس نوع ميزبان در دو گروه مختلف قرار گرفتند. قدرت تمايز بالاي اين نشانگر نشان داد كه مي‌توان از rep-PCR به عنوان يك روش مفيد و سريع براي بررسي تنوع ژنتيكي جدايه‌هاي M. cannonballus استفاده كرد.

Root rot and vine decline of cantaloupe and muskmelon plants is an economically important disease in Iran caused by Monosporascus cannonballus. Regarding the recent detection of the disease in Iran, genetic diversity of the causal agent need further research. In this study, isolates of M. cannonballus were collected from Esfahan, Yazd, Tehran, Fars, Semnan, Markazi, Ghazvin, SistanBaluchestan and Khorasan Razavi provinces. Genetic diversity between 50 isolates of the pathogen was studied using Rep-PCR markers; Box and ERIC. Reproducible fragments were between 100 and 1500bp and the genetic diversity amongst the isolates calculated 0.32. There was a correlation between genetic diversity, host and geographic origin of the isolates. M. cannonballus isolates were placed in two groups based on their host plant. Cluster analysis using UPGMA method and Diceʹs coefficient revealed 100% similarity between some isolates collected from different regions. There was a correlation between colony morphology in the culture media and genetic diversity where at %80 similarity level the isolates were placed in three different groups. The discriminatory power of rep-PCR was high, indicating that rep-PCR is a rapid, effective marker for genotyping M. cannonballus isolates.