بررسي تنوع ژنتيكي برخي از پايه هاي پاكوتاه كننده سيب با استفاده از نشانگر مولكولي RAPD

Evaluation of Genetic Diversity in some Apple Dwarf Rootstocks (Malus Spp.) Using RAPD Molecular Markers

در اين تحقيق تنوع ژنتيكي 19 پايه اصلاح شده سيب در انگلستان و روسيه كه از مناطق مختلف ايران جمع آوري شده همراه با 12 ژنوتيپ و پنج نمونه حاصل از كشت بافت به كمك نشانگرDNA (RAPD) مورد بررسي قرار گرفت. تعداد 100 آغازگر تصادفي در انجام واكنش PCR روي نمونه ها ارزيابي شد كه 10 آغازگر تكثير DNA الگو را به خوبي انجام داده و بين نمونه ها چند شكلي قابل ملاحظه اي نشان دادند. اين 10 آغاز گر در مجموع 160 باند در كل نمونه ها تكثير كردند كه 136 باند چند شكل بودند. تجزيه كلاستر نمونه ها بر اساس باندهاي چند شكل با استفاده از ضريب تشابه دايس و به روش UPGMA انجام گرفت. بيشترين تشابه ژنتيكي (90%) بين پايه پاكوتاه كننده B.9a و B.9b بدست آمد. در تجزيه كلاستر، نمونه ها در حد تشابه 60/0 در چهار گروه مجزا جاي گرفتند. گروه بندي پايه هاي پاكوتاه كننده سيب در اغلب موارد با مناطق جمع آوري آنها مطابقت خوبي نشان داد كه نشان دهنده زمينه ژنتيكي نزديك و يا داشتن والد مشترك مي باشد. ضريب كوفنتيكي بين ماتريس تشابه و دندروگرام در حد 89/0 r= بدست آمد كه برازش مناسب دندروگرام با ماتريس تشابه را نشان داد. به علاوه، اين آزمايش نشان داد كه نشانگر RAPD براي گروه بندي نمونه هاي سيب پايه پاكوتاه كننده يك تكنيك موثر و مفيد است.

Genetic diversity of 36 genotypes of dwarf and semi-dwarf apple rootstocks along with seven Iranian dwarf rootstocks were investigated by use of RAPD DNA markers. A set of 100 random primers was utilized in PCR reaction from which 10 primers resulted in good amplification with high polymorphism. Among primers, 10 selected RAPD primers produced 160 bands, in which, 136 were polymorphic. Cluster analysis was done based on polymorphic bands using Dice similarity coefficient and UPGMA method. The highest genetic similarity (90%) was detected between B9a and B9b samples. Grouping of dwarf apple rootstocks showed the most proper correlation with their sampling area, showing either close genetic background or existence of the same parents. In cluster analysis, four distinct groups of 0.6 similarities were identified. Cophenetic coefficient between similarity matrices and dendrogram was 0.89, showing a proper fit of dendrogram with similarity matrices. This experiment showed RAPD markers as a suitable and efficient technique to differentiate apple Dwarf rootstock samples.