بررسي تنوع ژنتيكي ماهي سوف سفيد (Sander lucioperca) در تالاب انزلي با استفاده از نشانگرهاي ريزماهواره

Studying the genetic diversity of Anzali wetland pikeperch (Sander lucioperca) using microsatellite markers

اين بررسي با هدف بررسي تنوع ژنتيكي ماهي سوف سفيد در تالاب انزلي با استفاده از نشانگرهاي ريز ماهواره‌اي انجام گرفت. بدين منظور تعداد 50 عدد نمونه بالغ ماهي سوف سفيد در سال 1388 از تالاب انزلي جمع آوري گرديد. از هر ماهي حدود 2 گرم از بافت نرم باله پشتي جدا و سپس در الكل 96 درصد نگهداري گرديد. DNA ژنومي هر يك از نمونه‌ها استخراج گرديد و سپس كميت و كيفيت DNA استخراج شده با استفاده از روش اسپكتروفتومتري و الكتروفورز ژل آگارز تعيين شد. واكنش زنجيره‌اي پليمراز (PCR) با استفاده از 15 جفت آغازگر ريز ماهواره انجام گرديد. محصولات تكثير شده از PCR با ژل پلي آكريل آميد 6 درصد الكتروفورز و با محلول نيترات نقره رنگ آميزي شد. تصوير ژلهاي تهيه شده توسط دستگاه مستند سازي ژل با استفاده از نرم افزار Biocapt ثبت گرديد. پس از رتبه دهي به الل ها، محاسبات ژنتيكي بر اساس تست AMOVA محاسبه گرديد. از ميان 15 جفت آغازگر ريز ماهواره تنها 6 جفت توليد باند هاي پلي مورفيك نمودند. ميانگين الل هاي مشاهده شده به ازاي هر جايگاه ژني 5/2 بود. دامنه Ho و He در تمامي لوكوس ها به ترتيب 80/0- 30/0 و 63/0- 25/0 بود كه كم‌ترين مقادير در لوكوس YP110 و بيشترين مقادير در لوكوس Pfla L9 مشاهده شد. علت كم بودن ميانگين اللي و تنوع ژنتيكي در ماهي سوف سفيد به تكثير مصنوعي اين ماهي نسبت داده شد. انحراف از تعادل هاردي واينبرگ در تعدادي از الل ها مشاهده شد كه علت آن نيز به عدم تصادفي بودن نمونه گيري به جهت كوچك بودن اندازه جمعيت و آميزش خويشاوندي ناشي از تكثير مصنوعي نسبت داده شد

The aim of this study was to analysis the genetic diversity of Anzali wetland pikeperch (Sander lucioperca) based on microsatellite markers. For this purpose, 50 samples of adult pikeperch from Anzali Wetland were collected. For each sample, 2 g dorsal fin tissues was collected and conserved in absolute alcohol for subsequent DNA extraction and amplification. Total genomic DNA was extracted from fin tissue and the quality and concentration of DNA were assessed using agarose gel electrophoresis and spectrophotometer. Polymerase Chain Reaction (PCR) was conducted using 15 pairs of microsatellite primers. PCR products were separated on 6% polyacrylamide gels and stained by silver nitrate. DNA bands were analysed using Biocapt and GenAlex software package. Out of 15 pairs of microsatellite, 6 polymorphic loci were produced. The average number of alleles found per locus was 2.5. The range of observed and expected hetrozygosities were 0.30-0.80 and 0.25-0.63 respectively which the lowest amount was found in locus YP110 and the highest was found in locus Pfla L9. The low average number of alleles and genetic diversity is due to the artificial propagation in this species. Deviations from Hardy-Weinberg equilibrium were found in some of alleles that can be referred to non-accidental sampling because of small population size and inbreeding.