تعيين برخي از مشخصات بيولوژيكي و مولكولي جدايه هاي ايراني ويروس بي بذري گوجه فرنگي

Partial biological and molecular characterization of Iranian isolates of Tomato aspermy virus

ويروس بي بذري گوجه فرنگي (Tomato aspermy virus, TAV) داراي دامنه ميزباني وسيعي مي باشد و اغلب در گياهان زينتي ايجاد آلودگي مي نمايد. به منظور شناسايي و بررسي خصو صيات ملكولي و بيولوژيكي اين ويروس، تعداد 436 نمونه گياهي ار استان هاي مختلف ايران جمع آوري گرديد. از بين نمونه هاي مورد بررسي آلودگي به TAV در سه نمونه از گياهان زينتي با استفاده از آزمون الايزا به روش ساندويچ دو طرفه مورد تاييد قرار گرفت. قطعه 687 جفت بازي مربوط به ژن پروتيين پوششي با استفاده از آزمون RT-PCR و يك جفت آغازگر اختصاصي، تكثير، سپس همسانه سازي و تعيين ترادف گرديدند. ترادف جدايه هاي ايراني با ديگر جدايه هاي TAV، ، موجود در بانك ژن مورد مقايسه قرار گرفت. نتايج حاصل از تجزيه فيلوژنتيكي بيانگر آن است كه جدايه هاي مورد بررسي در دو گروه اصلي I و II قرار مي گيرند، كه گروه II نيز به دو زير گروه IIA و IIB تقسيم مي گردد. هر سه جدايه ايراني در زير گروه IIA واقع مي گردند. همچنين جدايه هاي ايراني داراي مشابهت بالاي ترادف نوكليوتيدي و اسيدهاي آمينه مربوط به ژن پروتيين پوششي به ميزان بيش از %99 با يكديگر مي باشند. نتايج حاصل از تعيين دامنه ميزباني سه جدايه ايراني TAV نشان دهنده آن است كه جدايه هاي ايراني از دامنه ميزباني گسترده اي بر روي گياهان آزمون برخوردار مي باشند. اين بررسي اولين گزارش از وقوع ويروس بي بذري گوجه فرنگي در ايران و معرفي گياه اطلسي به عنوان ميزبان جديد اين ويروس در دنيا مي باشد.

Tomato aspermy virus (TAV) has a wide host range and usually infects ornamental plants. To identify and characterize molecular and biological properties of the virus, 436 samples were collected from various provinces of Iran. TAV was detected in three samples of ornamental plants through double antibody sandwich ELISA test using specific polyclonal antibody. The 687 bp segment including the coat protein (CP) gene was amplified by RT-PCR, cloned and sequenced. Nucleotide sequences of the CP gene of Iranian TAV isolates were compared with available GenBank isolates. Phylogenetic analysis showed that TAV isolates were classified into two groups I and II, and the group II was divided in two subgroups IIA and IIB. All the Iranian TAV isolates were classified in subgroup IIA and shared the high nucleotide and amino acid sequence identities (more than 99%). The results of this study also showed a wide host range of the Iranian TAV isolates among test plants. This study is the first report of TAV occurrence in Iran and the first natural occurrence of TAV on Petunia hybrida in the world.