ارزيابي آزمون انساب درتعدادي از گاوهاي هلشتاين با استفاده از نشانگرهاي ريزماهواره نشاندار شده با فلورسانس

Evaluation of Parentage Test in some of Holstein Cattle Using Fluorescent Labeled Microsatellite Markers

به منظور ارزيابي آزمون انساب با استفاده از جايگاههاي ريزماهواره اي، تعداد 8 نمونه از جمعيت گاوهاي هلشتاين ايراني مركز اصلاح نژاد و بهبود توليدات دامي كشور بدون آنكه هيچ اطلاعاتي از هويت و روابط ژنتيكي بين آنها در اختيار قرار داده شود با استفاده از 12 جايگاه ريزماهواره اي توصيه شده انجمن بين المللي ژنتيك حيواني (ISAG) مورد آزمون قرار گرفتند. ژنوتيپ هر فرد با استفاده از يك سري 12 جفتي از آغازگرهاي نشاندارشده فلورسنتي تعيين گرديد. پس از برآورد فراوانيهاي آللي و ژنوتيپي و شبيه سازي داده ها در نسخه 2 نرم افزار CERVUS، آزمون انساب انجام و روابط ژنتيكي ميان افراد مورد آزمون بدست آمده و مورد تاييد مركز ارسال كننده قرار گرفت. در روابط ميان اين افراد، انواعي از مناسبات شامل تكرار يك فرد با شماره هاي متفاوت، وجود يك و هر دو والد براي يك فرزند مشاهده شد. ميانگين هتروزيگوسيتي مورد انتظار حاصل از 11 جايگاه بررسي شده در اين تحقيق 72/0 و متوسط PIC در آنها 631/0 بود. بجز جايگاه TGLA53 كه به دليل اشتباه در خوانش آلل و كيفيت نامناسب ژنوتيپ هاي قرايت شده از آناليز نهايي حذف گرديد، مجموع مقادير حاصل از EP 11 جايگاه ديگر نشان داد كه جايگاههاي مورد مطالعه به خوبي و با دامنه اطمينان بسيار مناسب قابليت انجام آزمون انساب و تعيين روابط ژنتيكي (والد – فرزندي) را دارا مي باشند و براي آزمون هاي انساب در جمعيت هاي بزرگتر و با شجره هاي پيچيده تر نيز توصيه مي شوند.

In order to evaluate paternity test using microsatellite markers, a small sample of Iranian Holstein cattle population including 8 unknown individuals without any given prior knowledge on their genetic relationships were tested using 12 microsatellite loci recommended by International Society of Animal Genetics (ISAG). They were genotyped by a multiplex PCR set consisted all 12 fluorescently labeled primer pairs. Allele and genotype frequencies were estimated and simulated by CERVUS 2.0 software for paternity analysis. Using this software parentage test and relationship between samples have been determined and confirmed by sample’s provider. Paternity relationship including one or two parents for an offspring and also repeated samples were observed. The average expected heterozygosity of 11 analyzed loci and the mean value for PIC was 0.72 and 0.631 respectively. Except TGLA53 locus that was excluded from further analyses due to low quality of alleles and genotype detection, total exclusion probability of 11 loci showed that the paternity test using microsatellite loci mentioned here can be successfully implicated in large scale in Holstein dairy cattle population in Iran.