شناسايي و آناليز فيلوژنتيكي ويروس بيماري نيوكاسل به روش مولكولي در طيور صنعتي استان اصفهان

Detection and Phylogenetic Analysis of Newcastle Disease Virus Based on Molecular Techniques in Broiler in Isfahan Province

ويروس بيماري نيوكاسل (APMV-1)، از خانواده Paramyxoviridae، تحت خانواده Paramyxovirinae و جنس Avulavirus مي‌باشد كه واجد هفت ژن3`NP/V-M-F-HN-L 5` است. اين بيماري در سرتاسر دنيا به عنوان يكي از مهمترين بيماري‌هاي ماكيان و ساير پرندگان به حساب آمده و مي تواند گاهي باعث مرگ و مير100 درصدي در طيور مبتلا گردد. به دليل اين كه طبيعت بيماري نيوكاسل حاد و وخيم است و عواقب متعاقب آن خطرناك است، بيماري مذكور از طرف دفتر بين‌المللي همه‌گيري‌ها (OIE) جز بيماري‌هاي ليست A گروه‌بندي شده است. به منظور تعيين قرابت ژنتيكي ژن F ويروس NDVدر ايران و مقايسه آن با ساير كشورها، در ابتدا قطعه 1097 جفت بازي مربوط به ژن M از 37 نمونه بافتي ويروس جهت شناسايي بيماري و سپس قطعه 1349 جفت بازي از ژنF جهت تعيين قرابت ژنتيكي، در سيستم RT-PCRتكثير داده شد. محصول PCRمربوط به ژن F، 4 نمونه مثبت جهت تعيين رديف نوكليوتيدي سكانس گرديد. نتايج حاصل از مقايسه رديف نوكليوتيدي تعيين شده در اين مطالعه با سكانس شناخته شده ژن F ويروس نيوكاسل در ساير كشورها نشانگر وجود 4/1 تا 3/27درصد تنوع ژنتيكي در اين ژن بود كه در اين ميان بيشترين قرابت با رديف نوكليوتيدي ژن F در هند (سكانس AY339401.1) و بيشترين تفاوت با رديف نوكليوتيدي شناخته شده اين ژن در ايالات متحده (سكانس ACD14136.1) مشاهده گرديد.

Newcastle disease virus (APMV-1) belongs to the genus of Avulavirus and the subfamily of Paramyxovirinae and family of Paramyxoviridae which contains seven genes NP/V-M-F-HN-L . Newcastle disease (ND) is regarded throughout the World as one of the most important contagious diseases of poultry and other birds that sometimes cause 100% mortality rate in poultry flock. It is recognized as a notifiable infectious disease (List A) by the World Organization for Animal Health (OIE). For the determination of genetic relationship between F gene of this virus in Iran and those in other countries, fragment 1097bp of M gene of 37 tissue samples was firstly obtained for the detection of Newcastle disease and fragment 1349bp of F gene was later used to analyze phylogenetic relationship of this virus. Corresponding to F gene, four NDV strains having been isolated from infected birds in Iran were amplified in PCR system and were sequenced for determining nucleotide sequence and were compared with identified nucleotide sequence of this gene in other countries. A comparison made on F gene in Iran with that of other countries showed 1.4 to 27.3% variability in this gene, in which the greatest sequence similarity exists between sequences of F gene in Iran and India (AY339401.1) and the least relationship exists between sequences of this virus in Iran with USA (ACD14136.1).