رديابي مولكولي ويروس واي سيب زميني با استفاده از آغازگرهاي عمومي در استان اردبيل

Molecular Detection of Potato virus Y using Universal Primers from Ardabil Province

چكيده ويروس واي سيب زميني (Potato virus Y, PVY) مهم ترين ويروس آلوده كننده ي مزارع بادمجانيان در سراسر جهان مي باشد. به منظور رديابي پوتي ويروس ها در مزارع گياهان خانواده ي بادمجانيان استان آذربايجان شرقي و اردبيل تعداد 112 نمونه ي گياهي با علايم موزاييك، ابلقي و زردي جمع آوري و بعد از بررسي با آغازگر هاي عمومي جنس پوتي ويروس، تعداد 23 نمونه آلوده تشخيص داده شدند. از بين نمونه هاي آلوده، نمونه هايي با علايم موزاييك و زردي به منظور رديابي ويروس PVY همسانه سازي و تعيين ترادف گرديدند و در نهايت يكي از جدايه هاي مورد بررسي به عنوان PVY شناخته شد. براي تعيين جايگاه تاكسونوميك جدايه ي ايراني، اين جدايه با توالي هاي 165 جدايه ي ديگر موجود در بانك اطلاعات ژني همرديف سازي و مقايسه شدند. آناليز فيلوژنتيك نشان داد كه جدايه هاي مقايسه شده در 5 گروه قرار مي گيرند و جدايه ي ايراني همراه با جدايه هاي آمريكا، كانادا، انگلستان، چين، سوريه، فرانسه و لهستان در گروه يك قرار گرفتند.

Abstract Potato virus Y (PVY) is the most important virus that infects Solanaceae family worldwide. In order to detect potyviruses from Solanaceae in East Azarbaijan and Ardabil provinces, 112 samples with mosaic, mottling and yellowing symptoms were collected. Then, the samples were checked by Reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) with Potyvirus universal primers which ended up in detection of the virus from 23 samples. In order to identify PVY, some of these samples with mosaic and yellowing symptoms were selected for cloning and sequencing. Finaly one of them was recognized as PVY. For determination of taxonomic position of PVY isolate from Iran, the sequence data from Iranian PVY was aligned and compared with the related 165 isolates from GeneBank. Results of phylogenetic analyses showed that PVY isolates were grouped in 5 clusters wherein the Iranian PVY isolate was placed in cluster 1 together with isolates from America, Canada, Syria, France, England, China and Poland.