بررسي تنوع ژنتيكي سيب هاي بومي ايران با استفاده از نشانگر SSR

Genetic Diversity Survey of Iranian Native Apples (Malus× domestica) Genotypes Using SSR Markers

تنوع ژنتيكي 44 رقم سيب از مناطق مختلف ايران به كمك 16 جفت نشانگر ريزماهواره مورد ارزيابي قرار گرفت. در كل 45 آلل در بين ارقام شناسايي شد. تعداد آلل ها در هر مكان ژني از2 تا 5 عدد متغير و با متوسط 8/2 بود. ميانگين تعداد آلل موثر 2/2، ميانگين هتروزيگوسيتي مورد انتظار و مشاهده شده به ترتيب 52/0 و 45/0 برآورد گرديد. با توجه به آزمون كاي اسكور در هر مكان ژني نتيجه گيري گرديد كه جمعيت مورد مطالعه از تعادل هاردي- واينبرگ پيروي نمي كند. محتوي اطلاعات چند شكل از 18/0 تا 76/0 متغير بود كه دلالت بر ظرفيت بالاي برخي نشانگرها در تفكيك و تمايز افراد دارد. بر اساس تجزيه خوشه اي به روش UPGMA ارقام مورد مطالعه در دو گروه اصلي قرار گرفتند. بر اين اساس بيش ترين شباهت ژنتيكي بين ارقام"سلماس 4" و"ديررس مشهد" و كم ترين ميزان آن بين ارقام "مشكي دماوند 2" و"سيفه شيرين" مشاهده گرديد. نتايج حاصل از اين پژوهش مي تواند در اتخاذ تدابير اصلاحي سيب مفيد واقع شود. در مطالعات تنوع ژنتيكي و اصلاح سيب، به علت طولاني بودن دوره نو نهالي و وجود شرايط ويژه درختان ميوه، به نظر مي رسد كه استفاده از نشانگرها با درجه چند شكلي بالا و درعين حال متصل به صفات خوب مفيد خواهد بود.

The genetic diversity of 44 apple genotypes from all over part of Iran was evaluated using 16 pairs of SSR primers. In Total, 45 alleles were detected. The number of alleles per locus varied from 2 to 5 with an average of 2.8. The average number of effective alleles was 2.2, the average of expected and observed heterozygosity were 0.52 and 0.45, respectively. According to Chi-square test, population was out of Hardy–Weinberg equilibrium. The Polymorphism Information Content (PIC) ranged from 0.18 to 0.76 implying the high detecting potential of some studied primers. Based on Jaccard’s coefficients similarity matrix for all studied apple genotypes, the highest similarity was observed between "Salmas4" and "Dirras-e Mashhad" and the The lowest one was found between "Meshki-e Damavand 2" and "Sifeshirin". Cluster analysis by using UPGMA algorithm revealed two main groups. Considering to long juvenile period in fruit trees such as apple, it seems that the application of markers with high degree of polymorphism and linked to appropriate trait would be useful in apple genetic diversity studies and breeding activities.