شناسايي قطعات كروموزومي 1RS چاودار در جنس Aegilops با استفاده از نشانگر مولكولي اختصاصي DNA

Identification of Chromosome Segments of Rye 1RS in Aegilops Genus using DNA Specific Molecular Marker

چاودار به عنوان يك منبع ژنتيكي خارجي توسط اصلاح گرها به وفور در افزايش تنوع ژنتيكي گندم استفاده شده است، و كروموزوم 1R و بخصوص بازوي كوتاه آن 1RS به فراواني به ژنوم گندم انتقال داده شده است. در مطالعات 1RS و انتخاب موثر از تكنيك‌هاي سيتوژنتيكي، بيوشيميايي و نشانگرهاي DNA استفاده مي‌شود. در اين مطالعه وجود قطعات كروموزومي چاودار در بعضي از گونه‌هاي خانواده گندميان با استفاده از يك جفت آغازگر اختصاصي 1RS (RyeR3/F3) بررسي شده است. براي اين منظور، از چاودار، گندم نان و تعدادي از گونه‌هاي جنس Aegilops، DNA ژنومي استخراج و واكنش زنجيره اي پليمراز با كمك آنزيم TaKaRa Ex TaqTM انجام گرفت. نتايج حاصل از اين پژوهش نشان داد كه توالي تكثيري مورد انتظار مربوط به رتروترانسپوزون‌هاي gypsy-like با طول bp1451 در DNA ژنومي گونه‌هاي چاودار، گندم نان، Ae. biuncialis، Ae. crassa، Ae. cylindrica،Ae. kotschyi ، Ae. speltoides و Ae. taushii بر روي ژل آگارز مشاهده و صحت باندها با كمك داده‌هاي حاصل از توالي‌يابي تاييد گرديد. با رسم درخت فيلوژنتيكي، گندم نان و چاودار در يك كلاستر و همچنين Ae. crassa، Ae. taushii، Ae. speltoides، Ae. cylindrica و Ae. biuncialis در كلاستر ديگري قرار گرفتند و Ae. kotschyi بيشترين فاصله ژنتيكي را از گندم و چاودار از نظر توالي رتروترانسپوزوني مورد بررسي داشت. اين نتايج نشان مي‌دهد كه اين توالي خاص رتروترانسپوزوني در ژنوم بسياري از گونه‌هاي خانواده گندميان وجود دارد.