عنوان مقاله :
كلونينگ ژن POL ويروس HIV-1 و تعيين زير گروه‌هاي آن
عنوان فرعي :
Cloning of HIV-1 POL gene and its Subtyping
پديد آورندگان :
تبار اسد لاله، رعنا نويسنده دانشجوي كارشناسي ارشد هماتولوژي ـ مركز تحقيقات انتقال خون ـ موسسه عالي آموزشي و پژوهشي طب انتقال خون ـ تهران ـ ايران Tabar Asad Laleh, .R , شريفي، زهره نويسنده PhD ويروس‌شناسي ـ دانشيار مركز تحقيقات انتقال خون ـ موسسه عالي آموزشي و پژوهشي طب انتقال خون ـ تهران ـ ايران ـ صندوق پستي: 1157-14665 Sharifi, .Z , قره‌باغيان، احمد نويسنده PhD ايمونوهماتولوژي باليني ـ دانشيار دانشگاه علوم پزشكي شهيد بهشتي ـ تهران ـ ايران Gharehbaghian, .A
اطلاعات موجودي :
فصلنامه سال 1391 شماره 37
كليدواژه :
كلوني‌ها , Clones , genetic diversity , HIV1 , HIV-1 , تنوع ژنتيكي
چكيده فارسي :
چكيده
سابقه و هدف
شناسايي تنوع ژنتيكي و سير تكاملي ويروسHIV در كشور، به بررسي مولكولي پيوسته و مداوم نياز دارد كه بتواند اطلاعات مفيدي در راستاي طراحي روش‌هاي درماني و تشخيصي جديد ارايه دهد. در اين مطالعه از روش ژن كلونينگ، جهت ارزيابي توزيع و تنوع ژنتيكي اشكال در حال گردش ويروس HIV-1استفاده شد.
مواد و روش‌ها
در يك مطالعه تجربي، 50 نمونه كه با روش الايزا، HIV مثبت بودند، بررسي شدند، تمام موارد معتاد تزريقي بوده و سابقه درمان آنتي رتروويرال نداشتند. ژن ريورس ترانس‌كريپتاز ويروس HIV-1 با روشNested RT- PCR و با استفاده از آغازگرهاي اختصاصي تكثير شد، سپس با استفاده از وكتور PTZ-57RT كلون شد و چندين كلون از هر بيمار تعيين توالي شد. توالي‌هاي به دست آمده از ژن ريورس ترانس‌كريپتاز با توالي‌هاي رفرانس كه از بانك اطلاعات جهاني به دست آمده بود، با استفاده از نرم‌افزار 8/1 ClustalW مرتب شد. سپس درخت فيلوژنتيك با استفاده از نرم‌افزار NJplot رسم شد.
يافته‌ها
از 50 نمونه مورد بررسي، 30 نمونه با استفاده از روش Nested RT-PCR تكثير شدند، آناليز نوكليوتيدها بر روي ژن ريورس ترانس‌كريپتاز با استفاده از چندين كلون از هر فرد انجام شد. تمام نمونه‌ها ساب‌تايپ CRF35-AD بودند.
نتيجه گيري
نتايج اين مطالعه نشان داد كه CRF35-AD ، شايع‌ترين تحت گونه نوتركيب در بين بيماران است. اطلاعات پيرامون تنوع ژنتيكي ويروس در افراد و ساب‌تايپ‌هاي ويروسي در گردش جامعه، مي‌تواند در طراحي روش‌هاي تشخيصي، برنامه‌هاي كنترل عفونت و درمان، مفيد باشد.
چكيده لاتين :
Abstract
Background and Objectives
The identification of the genetic diversity and evolution of HIV-1 in the country needs constant molecular survey which could represent useful information to design new diagnostic and therapeutic strategies. Gene cloning strategy was used to evaluate the distribution and genetic diversity of the HIV-1 circulating forms.
Materials and Methods
Overal, 50 HIV-1 seropositive subjects were enrolled in the study. All of them were IDUs and had no history of antiretroviral therapy. The reverse-transcriptase genes of HIV-1 were amplified by nested RT-PCR using specific primers. Then, the RT gene of HIV-1 was cloned into a cloning vector PTZ-57R. Multiple clones from each patient were sequenced. The obtained sequences were aligned with the reference sequences, retrieved from the GenBank database. Multiple sequence alignments were performed by using the ClustalW 1.8 software package. Phylogenetic trees were generated by using the neighbor-joining plot.
Results
Of 50 serum samples, 30 were HIV RNA positive by nested RT-PCR. The nucleotide sequence analysis was performed on the RT genes from multiple clones. All samples were of HIV-1 CRF35-AD strains.
Conclusions
Data showed that CRF35-AD strain is the most prevalent in HIV infected patients. Information on the genetic diversity of viruses in patients and also viruses circulating in the community can be useful in design of diagnostic procedure, infection control programs and treatment.
اطلاعات موجودي :
فصلنامه با شماره پیاپی 37 سال 1391
كلمات كليدي :
#تست#آزمون###امتحان
