بررسي تنوع ژنتيكي در اسب اصيل تركمن ايران با استفاده از 4 جايگاه ريزماهواره

Study of Genetic Diversity in Iranian Turkmen Horse by Four Microsatellite Markers

هدف از اين پژوهش بررسي تنوع ژنتيكي اسب اصيل تركمن ايران با استفاده نشانگرهاي ريزماهواره بود. تعداد 51 نمونه خون از اسب‌هاي اصيل تركمن در منطقه راز و جرگلان در خراسان شمالي جمع آوري شد. DNA ژنومي استخراج، سپس واكنش زنجيره اي پليمراز براي تكثير قطعات چهار جايگاه ريزماهواره (HMS02، HMS03، HMS07 و AHT04) با استفاده از جفت آغازگر‌هاي اختصاصي به صورت استاندارد انجام شد سپس محصولات واكنش زنجيره‌اي پليمراز چهار جايگاه بر روي ژل اكريل آميد 8 درصد الكتروفورز و رنگ‌آميزي شدند. نتايج اين تحقيق نشان داد كه تعداد آلل هاي چهار جايگاه مورد مطالعه از 9 تا 12 آلل متغير بودند كه بيشترين تعداد آلل در جايگاه ژني HMS02 (12 آلل) و كمترين تعداد آلل در جايگاه ژني HMS07(9آلل) مشاهده ‌شد. بيشترين مقدار هتروزيگوسيتي(8847/0) در جايگاه HMS02 و كمترين مقدار اين معيار (8039/0) در جايگاه HMS03 مشاهده شد. بيشترين مقدار اطلاعات چند شكلي PIC (86/0) مربوط به جايگاه (HMS07) و كمترين مقدار اين معيار (77/0) مربوط به جايگاه HMS03 بود. بيشترين و كمترين مقدار شاخص شانون (2617/2 و 0532/2 ) نيز به ترتيب در جايگاه‌هاي ژنيHMS07 و AHT04 برآورد گرديد. نتايج نشان دادند كه 4 جايگاه ريزماهواره مطالعه شده چند شكلي بالايي دارند و مي‌توانند به عنوان نشانگر ملكولي مناسبي در مطالعات ژنتيكي مورد استفاده قرار گيرند.

The aim of this study was to assess the genetic diversity of Iranian Turkmen Horse using microsatellite markers (HMS02, HMS03, HMS07 and AHT04). Blood samples were collected from 51 Turkmen horses in Khorasan Shomali province, Iran. Genomic DNA was extracted and then standard Polymerase Chain Reaction performed to amplify the microsatellite markers using specific primers. The PCR products were electrophoresed on 8% polyacrylamide gel. The results have demonstrated that the number of alleles in these loci varied from 9 to 12 with mean value of 10.5. HMS02 and HMS07 had the highest (12) and the lowest (9) number of alleles, respectively. HMS02 had the highest (0.8847) and HMS03 had the lowest (0.8039) heterozygosity rates. Also, polymorphic information content (PIC) was the highest (0.86) in HMS07and the lowest (0.77) in HMS03. Finally, the highest and the lowest value of Shannon index were estimated in HMS07 and AHT04, respectively. Results have shown that these four microsatellite loci have high polymorphism and can be used as suitable molecular markers in genetic studies.