مقايسه برازش عملكرد توابع چند جمله اي در مدل رگرسيون تصادفي براي ركوردهاي روزآزمون توليد شير گاوهاي هلشتاين ايران

Comparison of Fitting Performance of Polynomial Functions in Random Regression Model for Test Day Milk Yield in of Iranian Holstein Dairy Cattle

در اين تحقيق، از 701212 ركورد روزآزمون توليد شير از دوره شيردهي اول، 199903 راس گاو شيري هلشتاين كه از سال 1385 تا 1389 توسط مركز اصلاح نژاد كرج جمع آوري شده بود، استفاده شد. مدل رگرسيون تصادفي با توابع چند جمله اي هاي لژاندر با درجات مختلف 2 تا 5 براي برازش اثرات ژنتيك افزايشي و محيط دايمي، ويلمينك و علي- شيفر تحت واريانس باقي مانده ثابت در كل دوره شيردهي مقايسه شدند. پارامترهاي ژنتيكي با استفاده از روش حداكثر درستنمايي محدود شده(REML) ، برآورد شدند. مقايسه مدل ها با استفاده از -2Logl، معيار اطلاعات آكايك (AIC)، معيار اطلاعات بيزي (BIC)، واريانس باقيمانده (RV) و آزمون نسبت درستنمايي (LRT) انجام گرفت. با توجه به نتايج بدست آمده، مدل رگرسيون تصادفي با چندجمله اي لژاندر (2،5) به عنوان بهترين مدل انتخاب شد. واريانس باقي مانده همراه با افزايش درجه برازش اثرات محيط دايمي در چند جمله اي هاي لژاندر، كاهش يافت. واريانس محيط دايمي در اوايل دوره شيردهي بالاتر از ديگر مراحل دوره شيردهي و واريانس ژنتيك افزايشي در اوايل دوره نسبت به انتهاي دوره شيردهي پايين تر برآورد شد. واريانس فنوتيپي توليد شير در طول دوره شيردهي ثابت نبود و در ابتدا و انتهاي دوره شيردهي بالاتر بود. دامنه وراثت پذيري در طول دوره شيردهي در بين توابع مختلف بين 08/0 تا 23/0 متغير بود.

In this research, 701212 test day record for milk yield of first lactation of 199903 Holstein cows from 2006 to 2010 that were collected by Karaj breeding center were used. Random regression model with Legendre polynomials fitting order 2 to 5 of additive genetic effects and permanent environmental effects, Wilmink and Ali-Schaeffer functions were compared under homogeneous residual variance assumption throughout lactation. Genetic parameters were estimated using restricted maximum likelihood (REML). For comparison of models, from -2logL, Akaike’s information criterion (AIC), Bayesian information criterion (BIC), Residual Variance (RV) and Likelihood ratio test (LRT) was used. Based on obtained results, random regression model with Legendre polynomial function (2,5) were chosen as better model. Residual variance decreased as the increase of fitting order for permanent environmental effects in Legendre polynomials. Permanent environmental variance was estimated higher in early lactation than the other lactation stages and additive genetic variance in the early lactation was lower than at the end of lactation. Phenotypic variance of milk yield during lactation was not constant, it was higher at the beginning and the end of lactation. The heritability during lactation did vary among different functions, range from 0.08 to 0.23.