عنوان مقاله :
كلونينگ ژن fimH اشريشياكلي يوروپاتوژن و بررسي تنوع توالي آن
عنوان فرعي :
fimH gene cloning, of Escherichia coli uropathogen and examination of its subsequence diversity
پديد آورندگان :
استادمحمدي، سمانه نويسنده دانشگاه آزاد اسلامي زنجان Ostad Mohammadi, Samaneh , شيرازي، محمد حسن نويسنده دانشگاه علوم پزشكي تهران Shirazi, MH , فلاح‌مهرآبادي، جليل نويسنده دانشگاه صنعتي مالك اشتر تهران Fallah Mehrabadi, Jalil , پورمند، محمدرضا نويسنده دانشگاه علوم پزشكي تهران Poormand, Mohammad Reza , حميديه ، فايزه نويسنده دانشگاه آزاد اسلامي زنجان Hamidyeh, Faezeh , ملاآقاميرزايي، هدروشا نويسنده دانشگاه علوم پزشكي تهران Molla Aghamirzaei, H , افشار، داود نويسنده ,
اطلاعات موجودي :
فصلنامه سال 1392 شماره 0
كليدواژه :
اشريشيا كلي يوروپاتوژن , پيلي‌تيپ I , ژن fimH , كلونينگ
چكيده فارسي :
زمينه: اشريشيا كلي يوروپاتوژن، شايع‌ترين پاتوژن جدا شده از مجاري ادراري محسوب مي‌شود، كه اغلب از فلور روده‌اي خود فرد منشا مي‌گيرد. عفونت مجاري ادراري، يكي از بيماري‌هاي شايع عفوني در انسان است. از آنجايي‌كه، مرحله اتصال در كلونيزاسيون باكتري نقش مهمي دارد و سپس عفونت ايجاد مي‌گردد، يكي از راه‌كارهاي مهم مهار عفونت، مهار اتصال باكتري مي‌باشد. به دليل اينكه، پروتيينFimH بهعنوان ادهسين عمل مي‌نمايد، براي تهيه واكسن كانديدي مناسب مي‌باشد.
مواد و روش‌ها: ابتدا استخراج DNA ژنوميك باكتري اشريشيا كلي سويهATCC 35218 انجام شد. پس از طراحي پرايمر براي ژن fimH، واكنش PCR، ابتدا با آنزيم Taq DNA Polymerase و سپس با آنزيمpfu DNA Polymerase صورت گرفت. از پلاسميد
(SK-)pBluescript ، براي كلون محصول PCR استفاده شد. با استفاده از نرم‌افزار ClustalW و MEGA4 توالي به‌دست آمده با توالي ژني موجود با تك ژن همترازگرديد و تنوع ژني آن بررسي گرديد.
يافته‌ها: پس از توالي يابي ژن fimH كلون شده، با استفاده از نرم‌افزار ClustalW و MEGA4 نتيجه اين سكانس با توالي سويه‌هاي اشريشيا كلي واجد ژن fimH موجود در بانك ژن همتراز شدند و بر اساس اين همترازي، ناحيه N ترمينال در سطح پروتيين و DNA حفاظت شده مي‌باشد.
نتيجه‌گيري: ناحيه‌ي N ترمينال FimH در بين سويه‌هاي باليني يك توالي حفاظت شده است و مي‌توان از آن براي طراحي واكسن عليه عفونت ادراري استفاده نمود.
چكيده لاتين :
Background: Escherichia coli uropathogen is the most prevalent pathogen separated from urinary tract that often is originated from intestinal flora of the own person. Urinary tract infection is one of the most prevalent infectious diseases in Human. Whereas binding stage has an important role in bacteria colonization and then the infection is created, one of the most important strategies for inhibiting the infection is inhibiting the bacterial binding. As FimH protein is acting as adhesion it could be an appropriate candidate for producingvaccine.
Material and Methods: First, genomic DNA of Escherichia coli bacteria extracted from strain 35218 ATCC. Upon designing primer for fimH gene, the PCR reaction has been applied with Taq DNA Polymerase and then pfu DNA polymerase enzymes. pBluescript (SK-) plasmid has been applied for cloning the product of PCR. Using ClustalW and MEGA4 software, the subsequence was alignmented with the gene subsequence existing in gene bank and its gene diversity was examined.
Results: After sequencing the cloned fimH gene using ClustalW and MEGA4 software, the result of this subsequence were alignmented with the subsequence of Escherichia coli containing fimH gene existing in gene bank and based on this alignment, N terminal on the protein surface and DNA are protected.
Conclusion: N terminal domain of FimH is a conserved sequence among clinical isolates and it could be used for designing a vaccine against urinary tract infection.
اطلاعات موجودي :
فصلنامه با شماره پیاپی 0 سال 1392
كلمات كليدي :
#تست#آزمون###امتحان
