مقاله كوتاه پژوهشي رديابي ويروس آبله آلو (PPV) در درختان ميوه هسته‌دار استان خراسان رضوي

Brief report Detection of Plum Pox Virus (PPV) from Stone Fruits in Khorasan Razavi Province, Iran

ويروس آبله آلو (Plum pox virus; PPV) عامل بيماري شاركا، متعلق به جنس Potyvirus از خانواده Potyviridae است و از برخي نقاط ايران گزارش شده است. جهت بررسي وجود اين ويروس در استان خراسان رضوي تعداد 553 نمونه از باغات درختان ميوه هسته‌دار در طي سالهاي 1389 و 1390 جمع‌آوري شد و آلودگي 12 نمونه با آزمون داس-الايزا به اثبات رسيد. در آزمون RT-PCR و با استفاده از پرايمرهاي اختصاصي، باندي در حدود bp467 در 3 نمونه تكثير گرديد. قطعه باند جدايه‌اي از منطقه كدكن از روي ژل استخراج و تعيين توالي شد. پس از همرديف سازي در ClustalW2 و رسم درخت فيلوژنتيكي با MEGA 5.1 مشخص شد كه جدايه ايراني تعيين توالي شده بيشترين تشابه را در سطح نوكليوتيدي (98 درصد) با دو جدايه ژاپني و درسطح آمينواسيدي (96درصد) با دو جدايه ژاپني و يك جدايه آمريكا داشته و كمترين تشابه را نيز با جدايه‌اي از اسلواكي دارد كه در سطح نوكليوتيدي 95 درصد و در سطح آمينواسيدي نيز 90 درصد مي‌باشد.

Plum pox virus (PPV), the causal agent of Sharka disease, belongs to the genus Potyvirus in the family Potyviridae and has been reported from some regions of Iran. Surveys were conducted to determine the incidence of the virus in Khorasan Razavi province in 2010 and 2011 and 553 samples of stone fruit trees were collected and tested by DAS-ELISA. In this method 12 samples were infected with PPV. RT-PCR with specific primers amplified 467bp band in 3 samples. DNA fragment of Kadkan region was sequenced after purification from gel. The determined sequence of IRN-KDN isolate were compared with previously reported 29 PPV isolates, using ClustalW2. In phylogenetic analyses based on ClustalW multiple alignment and MEGA 5.1, IRN KDN displayed the highest (98% and 96%) identity with two Japanese isolates and the lowest (95% and 90%) identity with isolate of Slovakia at nucleotide and amino acid sequence levels, respectively