مطالعه شجره شناسي جدايه‌هاي ويروس برونشيت عفوني پرندگان در ايران طي سال‌‌‌هاي 1389-1388 براساس قطعه ژن گليكوپروتيين ‌1S

Phylogenetic study of Iranian infectious bronchitis virus isolates during 2010-2011 using glycoprotein S1 gene

زمينه مطالعه: برونشيت عفوني پرندگان بيماري حاد، بسيار مسري، با انتشار جهاني مي‌باشد، جهش‌هاي نقطه‌اي و نوتركيبي ژنوم ويروس موجب تكامل مداوم آن شده و بنابراين ظهور واريته‌هاي ويروس برونشيت عفوني پرندگان كنترل اين بيماري را پيچيده نموده است. هدف: بررسي خصوصيات ژني واريته‌هاي جديد ويروس برونشيت عفوني جدا شده در مرغداري‌هاي صنعتي ايران در نمونه‌هايي كه بين سال‌هاي 1388 و 1389 جمع آوري گرديده است. روش كار: قطعه اي از ژن پروتيين ‌1S، ناحيه پر تغيير و پايدار ويروس برونشيت را پوشش مي‌دهد، با استفاده از روش RT-PCR متـداول تكثيـر و تعييـن تـوالـي گـرديـد. نتـايج: تجزيه و تحليل فيلوژني چهار ويروس را نشان داد كه به اسامي 891Razi-HKM، 892Razi-HKM، 893Razi-HKM و ‌894Razi-HKM ناميده شدند. مقايسه اسيدهاي آمينه القايي آنها با ساير ژنوتيپ‌ها ويروس برونشيت عفوني پرندگان، انتشار يافته در پايگاه اطلاعات بانك ژن، دلالت دارد كه جدايه ‌891Razi-HKM و 894Razi-HKM داخل سروتيپ بيماريزا ‌/B793 قرار دارند، در حـاليكـه جـدايـه‌هـاي ‌892Razi-HKM و 893Razi-HKM بـا جـدايـه‌هـايي كه قبلا در ايران شناخته شده بودند كاملاً تفاوت داشتند. جدايه 893Razi-HKM بـا جـدايـه‌هـاي كشـورهـاي خـاور ميانه كه اخيراً انتشار يافته است قرابت زياد داشت و احتمالاً جدايه جديد در ايران مي‌باشد. نتيجه‌گيري‌نهايي: يافته‌هاي اين مطالعه بهبود استراتژي‌هاي كنترل بيماري را ضرورت دانسته و لذا اهميت برقراري سيستم پايش مستمر بيماري برونشيت عفوني پرندگان و به اشتراك گذاشتن اطلاعات در جوامع علمي جهاني را تاكيد مي‌نمايد، اين امر مي‌تواند خلل اپيدميولوژي بيماري در منطقه را پر كند و توانمندي تشخيص را معتبر سازد.

BACKGROUND: Infectious bronchitis is an acute, highly contagious, viral disease of poultry with worldwide distribution, and is continuously evolving through point mutation and recombination of their genome; subsequently the emergence of IBV variants complicates disease control. OBJECTIVES: To investigate genetic characterization of new IBV variants isolated from commercial chicken flocks in Iran collected between 2009 and 2010. METHODES: The partial S1 gene of the spike protein, covering a hypervariable and constant regions, was amplified and sequenced using conventional RT-PCR. RESULTS: Phylogenetic analysis revealed four viruses designated as Razi-HKM891, Razi-HKM892, Razi-HKM893 and Razi-HKM894. Deduced amino acid sequence comparison with other IBV genotypes, published in the GenBank database, indicated that the isolates Razi-HKM891 and Razi-HKM894 were placed into the pathogenic 793/B serotype. However, the isolates Razi-HKM892 and Razi-HKM893 were different with previously described isolates in Iran. The Razi-HKM893 is closely related to recently published isolates from countries in Middle East and likely indigenous to Iran. CONCLUSIONS: These findings is essential for improving the disease control strategies and thus emphasize the importance of continuous surveillance of the disease and of sharing the information to the global scientific community, which would help to fill the epidemiological gaps in the regions and to validate the robustness of diagnostic screening.