پديد آورندگان :
مهرشاد، مليحه نويسنده دانشجوي دكتري ميكروبيولوژي، دانشگاه تهران، ايران Mehrshad, Maliheh , آموزگار، محمد علي نويسنده , , يخچالي، باقر نويسنده دانشيار ميكروبيولوژي، پژوهشگاه ملي مهندسي ژنتيك و زيست فناوري، تهران، ايران Yakhchali , Bagher , شاهزاده فاضلي، ابوالحسن نويسنده استاديار ژنتيك مولكولي، مركز ملي ذخاير ژنتيكي و زيستي، تهران، ايران Seyed Abolhassan , Shahzade Fazeli
كليدواژه :
باكتري نمك دوست نسبي , تنوع زيستي , درياچه پرشور اروميه , باكتري تحمل كننده نمك
چكيده فارسي :
مقدمه: درياچه اروميه واقع در شمال غربي ايران بزرگترين درياچه دايمي ايران و يكي از سه درياچه شور دايمي در سطح جهان است. از چهار منطقه غربي اين درياچه نمونه‌برداري انجام شد و تنوع ميكروارگانيسم‌ها با روش‌هاي مبتني بر كشت و مستقل از كشت بررسي شد.
مواد و روشها: در روش مبتني بر كشت، باكتريهاي هالوفيل و هالوتالرنت در شرايط هوازي در چهار محيط كشت MH، SWN، SWNLN و MHLN جداسازي شدند. جدايه ها بر اساس تفاوت‌هاي كلوني، واكنش گرم، رنگ‌آميزي اسپور و ويژگي‌هاي بيوشيميايي اوليه تفكيك شدند. محتواي ژنومي نمونه هاي محيطي آب و خاك براي بررسي هاي مستقل از كشت استخراج شد. با استفاده از تكثير S rRNA16 و كلونينگ كتابخانه ژن S rRNA16 تهيه و 20 درصد كلون هاي نوتركيب حاصل تعيين ترادف شدند.
نتايج: از بين 217 جدايه حاصل در روش مبتني بر كشت ژن S rRNA16 براي 52 سويه ترادف يابي شد كه از نظر فيلوژنتيك در جنس‌هاي Halobacillus، Halomonas، Planococcus، Gracilibacillus، Bacillus، Pontibacillus، Paracoccus، Marinobacter، Providencia، Staphylococcus، Alkalibacterium، Sanguibacter، Lysobacter، Kocuria، Pontibacter، Salicola، Micrococcus، Oceanobacillus، Brevundimonas، Thalassobacillus، Microbacterium و Piscibacillus قرارگرفتند. در روش مستقل از كشت كلون هاي بررسي شده در جنس هاي Salinibacter، Adhaeribacter و Cesiribacter قرار گرفتند.
بحث و نتيجهگيري: در روش مبتني بر كشت بين جدايه هاي تعيين توالي شده 18 جدايه شباهت كمتر از 7/98 درصد با سويه استاندارد نشان دادند كه محدوده مرزي براي ارايه گونه جديد ميكروبي بومي است. در روش مستقل از كشت كلون هاي بررسي شده در گروه Bacteroidetes قرار گرفتند. كه مشابه با ساير گزارش هاي موجود در مورد محيط هاي پر شور بررسي شده است.
چكيده لاتين :
Introduction: Urmia Lake, located in the northwest of Iran, is the largest permanent lake in Iran and one of the three permanent hypersaline lakes in the world. Microbial sampling from four western different regions of the lake was done and then, biodiversity of the samples were studied by culture dependent and culture independent methods.
Materials and Methods: In culture dependent methods, halophilic and halotolerant bacteria were isolated under aerobic condition on four growth media, MH, SWN, MHLN and SWNLN. Differentiation of bacterial isolates was performed based on colony features, Gram staining and primary biochemical tests. In culture independent method, environmental DNA from water and soil samples were extracted. After 16S rRNA PCR amplification 16S rRNA library was constructed and 20% of clones were sequenced.
Results: Within 217 purified isolates in culture dependent methods, 52 strains were selected for 16S rRNA gene sequencing and representatives of Halobacillus, Halomonas, Planococcus, Gracilibacillus, Bacillus, Pontibacillus, Paracoccus, Marinobacter, Providencia, Staphylococcus, Alkalibacterium, Sanguibacter, Lysobacter, Kocuria, Pontibacter, Salicola, Micrococcus, Oceanobacillus, Brevundimonas, Thalassobacillus, Microbacterium and Piscibacillus genera were identified. In culture independent method, selected clones belonged to Salinibacter، Adhaeribacter and Cesiribacter genera.
Discussion and Conclusion: In culture dependent selected strains 18 strains showed less than 98.7% sequence similarity to the closest known strains and were representatives as new taxa of Urmia lake. In culture independent method selected clones belonged to Bacteroidetes category. Data obtained from this study were similar to other scientific reports from hypersaline lakes.
Key words: Halotolerant bacteria, Moderately halophilic bacteria, Biodiversity, Urmia Hypersaline Lake
