تعيين قرابت فيلوژنتيك قسمتي از ژن gB هرپس ويروس 2 گوسفندي در مناطقي از ايران

Phylogenetical analysis of a part of ovine herpesvirus 2 gB gene in some areas of Iran

بيماري تب نزله‌اي بدخيم (MCF)، بيماري ويروسي بسيار كشنده‌اي در گاو است كه از نظر سبب‌شناسي به دو فرم مرتبط با ويلدبيست (WA-MCF) و مرتبط با گوسفند (SA-MCF) ديده مي‌شود. به منظور تعيين ميزان قرابت ژنتيكي ژن gB اين ويروس در ايران و مقايسه آن با موارد مشابه در ساير كشورها، در ابتدا قطعه 1501 جفت بازي مربوط به اين ژن از 5 نمونه (3 نمونه گوسفند سالم با سن بالاي يك سال و 2 نمونه گاو مبتلا به فرم باليني MCF) در سيستم PCR تكثير و توالي نوكليوتيدي آنها تعيين گرديد. در پنج نمونه سكانس شده در ايران 4/6 تا 3/9 درصد تنوع در ژن gB مشاهده شد. نتايج حاصل از مقايسه توالي نوكليوتيدي تعيين شده در اين مطالعه با سكانس شناخته شده ژن gB ويروس SA-MCF در ساير كشورها نشان داد كه 6/0 تا 9/29 درصد تنوع ژنتيكي در اين ژن وجود دارد كه در اين ميان بيشترين قرابت با توالي نوكليوتيدي ژن gB در امريكا (شماره دسترسي AF385439.1) و بيشترين تفاوت با توالي نوكليوتيدي شناخته شده اين ژن در هند (شماره دسترسي EF633446.1) مشاهده شد.

Malignant Catarrhal Fever (MCF) is one the most important viral diseases of livestock. Aetiologically, there are two forms of the disease, one is associated with Alcelaphine herpes virus-1 (AlHV-1) of the wildebeests, and the other (SA-MCF) with Ovine herpes virus-2 (OHV-2). To determine the genetic relationship of gB gene of OHV-2 in Iran with those in other countries firstly fragments 1501bp corresponding to gB from five samples (2 samples from clinically ill cattle with MCF and 3 samples from sheep more than one year-old) were amplified in PCR system and nucleotide sequences were compared and nucleotide sequence of this gene was identified in Gene Bank. The given results indicate the presence of 6.4 to 9.3% variability in gB gene in five sequenced samples in Iran. A comparison made on gB gene in Iran with other countries showed 0.6 to 29.9% variability in gB gene, of which the greatest sequence similarity exists between sequences of gB in Iran with USA (AF385439.1) and the least relationship exists between sequences of this virus in Iran with India (EF633446.1).