مطالعه پايداري ساختماني آنزيم پپسين درحضور اوره

Structural study on pepsin stability in the presence of urea

آنزيم پپسين(E.C.3.4.23.1) نوعي آسپارتيك پروتييناز شيره معده است كه در شرايط بسيار اسيدي عمل مي كند. اين آنزيم به طبقه هيدرولازها تعلق دارد و ساختمان منومر شامل دو لوب كروي بوده كه از نظر اندازه و فولدينگ زنجير پلي پپتيدي بسيار نزديك هستند. اين آنزيم واجد يك رشته پلي پپتيدي با وزن مولكولي 34644 دالتون و327 اسيدآمينه است. آناليز ساختاري آن نشان مي دهد كه2/1 درصد اسيدآمينه هاي آن بازي، 1/13درصد اسيدي، 5/46 درصد اسيدآمينه هاي قطبي و2/39درصد اسيدآمينه هاي هيدروفوبيك هستند. پايداري ساختاري اين آنزيم با استفاده از تكنيك هاي اسپكتروفتومتري در ناحيه ماورا بنفش و اسپكتروفلوريمتري درحضور تاثير دگرگون كننده اوره بررسي شد. مطالعه فوق با استفاده از بافر02/0 مولار سديم فسفات با 2=pH و در دامنه دمايي 30 تا 100 درجه سانتيگراد انجام شد. نتايج به دست آمده نشان داد كه: 1. پايداري قابل توجه آنزيم پپسين(Tmبالا نسبت به سايرهيدرولازها) 2. كاهش پايداري حرارتي آنزيم پپسين(Tm آنزيم) درحضور اوره و 2=pH؛ 3. كاهش مقادير پارامترهاي ترموديناميكي و درحضوراوره 4. افزايش شدت فلويورسانس و ماكزيمم طول موج نشر آنزيم پپسين در حضور اوره.

Pepsin (E.C.3.4.23.1) is a juice gastric aspartic proteinase. It belongs to hydrolyses family. Its monomeris structure is consisting of two lobes that they are similar in size and folding. It consists of a single polypeptide chain of molecular weight 34644 Dalton and 327 amino acids. Structural analysis shows that pepsin contains 1.2% basic residues, 13.1% acidic residues, 46.5% polar residues and 39.2% hydrophobic residues. Structural stability of pepsin was investigated by UV-VIS spectrophotometer and spectrophlorimetry. Spectral measurements were made by sodium phosphate buffer (.02M) at pH: 2 and temperatures between 30 and 100 ? C. It was observed that 1. High considerable enzyme stability, 2. Enzyme stability decreases in the presence of urea at pH: 2. 3. thermodynamic parameters decline in the presence of urea. 4. Florescence intensity increase in the presence of urea.