مطالعه مورفولوژيكي و فيلوژنتيكي تعدادي از گونه‌‌هاي Fusarium متعلق به گونه مركب Gibberella fujikuroi در ايران

Morphological and phylogenetic investigation on selected Fusarium species belong to Gibberella fujikuroi species complex in Iran

گونه مركب Gibberella fujikuroi با فرم غيرجنسي Fusarium spp. عامل تعدادي از بيماري هاي گياهي مهم مي باشد و گونه‌هاي شناسايي شده در اين گونه مركب متابوليت هاي ثانويه متعددي توليد مي كنند. در تحقيق حاضر، ارزيابي مورفولوژيكي 46 جدايه به دست آمده از ميزبان هاي برنج، ذرت، نيشكر و پياز و مطالعه فيلوژنتيكي 22 جدايه منتخب از اين گونه ها براساس توالي يابي نوكليوتيدي نواحي ITS1-5.8S-ITS2 و ژنEF-1? انجام گرديد. با ارزيابي ويژگي هاي مورفولوژيكي 46 جدايه از جنس Fusarium، پنج گونه F. fujikuroi، F. proliferatum،F. sacchari ،F. verticillioides و F. thapsinum شناسايي شدند. دو جدايه به دست آمده از نيشكر از نظر مورفولوژيكي به گونه F. verticillioides بسيار شبيه بودند، اما توالي يابي ژن EF-1? نشان داد كه جدايه ها متعلق به گونه F. andiyazi مي باشند. براساس توالي يابي ژن EF-1? شش كلاد اصلي مشخص شد و اين ژن توانست تمامي گونه هاي مورد بررسي در اين تحقيق را به خوبي از يكديگر تفكيك نمايد. اين در حالي است كه نواحي ITS1-5.8S-ITS2 پنج كلاد اصلي را مشخص نمود. نواحي ITS1-5.8S-ITS2 گونه هاي F. proliferatum و F. verticillioides را از يكديگر متمايز نمود، اما اين نواحي قادر به تمايز گونه هاي F. proliferatum و F. fujikuroi و همچنين دو گونه F. andiyazi و F. verticillioides از يكديگر نبودند. در مجموع مي-توان بيان كرد كه ژن EF-1? براي شناسايي سريع گونه هاي فوزاريوم بسيار مناسب مي باشد.

The Gibberella fujikuroi species complex with Fusarium anamorphs is the causal of diverse diseases of many important plants. Many of the known species in this species complex produce a wide range of secondary metabolites. In this study, morphological characteristics of 46 isolates from rice, maize, sugarcane and onion and phylogenetic relationships of 22 isolates on the basis of ITS1-5.8S-ITS2 region and EF-1? gene sequences were investigated. According to the morphological characteristics of 46 isolates, five species including F. fujikuroi,F. proliferatum, F. sacchari, F. thapsinum, and F. verticillioides were identified. Moreover, earlier morphologically two isolates obtained from sugarcane were very similar to F. verticillioides but, using EF-1? gene sequence were identified as F. andiyazi. On the basis of EF-1? sequence, six clades were identified and differentiated all of six species (F. andiyazi, F. fujikuroi, F. proliferatum, F. sacchari, F. thapsinum andF. verticillioides) from one another. Moreover, sequencing of ITS1-5.8S-ITS2 region identified five clades and differentiated F. proliferatum and F. verticillioides from each other but this region could not differentiate F. proliferatum and F. fujikuroi or F. andiyazi andF. verticillioides from each other. Generally, EF-1? gene was appropriate for differentiation of Gibberella fujikuroi species complex.