اپيدميولوژي مولكولي ويروس سينسيشيال تنفسي انسان در كودكان ايراني زير پنج سال در سال 1386: بررسي 72 نمونه

Molecular epidemiology of human respiratory syncytial virus in Iranian children less than 5 years in 2007: a study on 72 cases

زمينه و هدف: ويروس سينسيشيال تنفسی انسان (HRSV) مهم‌ترين عامل ويروسی عفونت‌های حاد دستگاه تنفسی تحتانی در نوزادان و كودكان در سرتاسر دنيا محسوب می‌شود. اين ويروس مسئول 50% از برونشيوليت و 25% از پنومونی ايجاد شده در نوزادان می‌باشد. با اين وجود اطلاعات كمی در رابطه با اپيدميولوژی مولكولی اين ويروس در كشورهای در حال توسعه وجود دارد. هدف از انجام اين مطالعه بررسی اپيدميولوژی مولكولی HRSV در ايران می‌باشد. روش بررسی: در اين مطالعه بر روی 72 نمونه تنفسی به‌دست آمده از كودكان زير پنج سال مبتلا به علايم حاد تنفسی در سال 1386، RT-PCR برای شناسايی ويروس HRSV براساس دومين ناحيه متغير گليكوپروتيين G صورت گرفته است. يافته‌ها: از 72 نمونه تنفسی آزمايش شده 14 نمونه (44/19%) از لحاظ HRSV مثبت بودند. بررسی‌های فيلوژنيك نشان داد نمونه‌های مثبت در سه ژنوتيپ از زير گروه A قرار داشتند: 12 سويه (71/85%) در ژنوتيپ GA2، يك سويه (1/7%) در ژنوتيپ GA1 و يك سويه (1/7%) در ژنوتيپ GA5. لازم به ذكر است كه‌در طی اين زمان هيچ ژنوتيپی از زيرگروه B يافت نشده است. نتيجه‌گيری: اين مطالعه حضور هم‌زمان چندين ژنوتيپ از زير گروه A در كودكان ايرانی زير پنج سال را نشان می‌دهد. با توجه به اين‌كه ژنوتيپ GA2 به‌عنوان ژنوتيپ غالب از چندين شهر از جمله تهران، اصفهان، كرج، قزوين، بندرعباس و شهرضا به‌دست آمده، ممكن است GA2، ژنوتيپ غالب HRSV در سال 1386 در ايران باشد. اين مطالعه تعيين ژنوتيپ HRSV به‌روش RT-PCR بر اساس ناحيه متغير دوم ژن G را به‌عنوان يك روش مؤثر در مطالعات بعدی اپيدميولوژی مولكولی HRSV در ايران معرفی می‌نمايد.

Background: Human respiratory syncytial virus (HRSV) is the most important viral agent of acute lower respiratory tract disease in infants and young children worldwide. This virus is responsible for 50% brochiolitis and 25% pneumonia in infants. There are limited data of molecular epidemiology of HRSV from developing countries. This is the report on the molecular epidemiology of human respiratory syncytial virus in Iran. Methods: In this study, RT-PCR for second hypervariable region of the HRSV G glycoprotein was performed on 72 throat swabs collected from children less than 5 years of age with acute respiratory symptoms in 1386. Results: Of the 72 throat swabs collected from children with acute respiratory symptoms, 14 (19.44%) were positive for HRSV. Phylogenetic analysis revealed that all HRSV-positive samples clustered in three genotypes of subgroup A: 12 strains (85/71%) in genotype GA2, 1 strain (7/1%) in genotype GA1, and 1 strain (7/1%) in genotype GA5. In this study we couldn’t identify any genotype of subgroup B. Conclusion: Our results revealed that multiple genotypes of subgroup A were co- circulated during 1386 in children less than 5 years of age in Iran. Also this study revealed that genotype GA2 was predominant genotype in isolates were obtained from several cities (Tehran, Isfahan, Karaj, Qazvin, Bandar Abbas, Shahreza), so we speculate that this genotype may be predominant during 1386 in Iran. This study supported that RT-PCR for second variable region of G protein is an effective method for further studies of HRSV genotype designation in Iran.