تعيين گروه فيلوژنتيكي و فراواني ژن هاي blaCTX-M و blaCTX-M-15 در جدايه هاي اشريشياكلي از عفونت هاي گوارشي و مجاري ادراري در كودكان زير 5 سال

Determination of Phylogenetic Group and Prevalence of blaCTX-M and blaCTX-M-15 Genes in Escherichia Coli Isolates from Intestinal and Urinary Tract Infections in under Five- Year- Old Children

زمينه و هدف: آنزيم هاي بتالاكتاماز وسيع الطيف نوع CTX-M، گروهي از آنزيم ها هستند كه به طور چشمگيري به ويژه در اشريشياكلي در حال افزايش هستند. گزارش هاي محدودي در مورد زمينه فيلوژنتيكي جدايه هاي اشريشياكلي از نمونه هاي باليني كودكان زير 5 سال در ايران وجود دارد. هدف از اين مطالعه فيلوتايپينگ جدايه هاي اشريشياكلي واجد ژن هاي blaCTX-15 و blaCTX-M از كودكان زير 5 سال مبتلا به اسهال و عفونت مجاري ادراري بود. روش بررسي: در مجموع 121 جدايه اشريشياكلي (75 اسهالي و 46 عفونت مجاري ادراري) از كودكان زير 5 سال جمع آوري گرديد. جدايه ها براساس آزمايش باكتري شناسي استاندارد تشخيص داده شدند. استخراج DNA جدايه هاي اشريشياكلي توسط روش هضم با سود صورت گرفت. آزمايش PCR به منظور فراواني ژن هاي blaCTX-15 و blaCTX-M در جدايه ها و همچنين به منظور تعيين گروه ها و تحت گروه هاي فيلوژنتيكي بوسيله شناسايي ژن-هاي yjaA و chuA و قطعه TspE4.C2 مورد استفاده قرار گرفت. يافته ها: جدايه ها متعلق به چهار گروه فيلوژنتيكي A (77/48 درصد)، B1 (04/14 درصد)، B2 (57/11 درصد) و D (62/25 درصد) بودند. در جدايه هاي اسهالي 37/13 درصد مثبت براي ژن blaCTX-M و 04/14 درصد براي دو ژن blaCTX-15 و blaCTX-M مثبت بودند. از 46 جدايه عفونت مجاري ادراري نيز 73/21 درصد براي ژن blaCTX-M و 21/15 درصد براي ژن هاي blaCTX-15 و blaCTX-M مثبت بودند. نتيجه گيري: فراواني نسبتا بالايي از جدايه هاي اشريشياكلي واجد ژن-هاي blaCTX-15 و blaCTX-M از كودكان زير 5 سال در شهرستان خرم آباد مشاهده گرديد. فيلوتايپينگ جدايه هاي واجد ژن هاي blaCTX-15و blaCTX-M نشان مي دهد كه اغلب آن ها در گروه هاي فيلوژني A و D تعلق داشتند. واژه هاي كليدي: اشريشياكلي، گروه فيلوژنتيك، بتالاكتاماز وسيع الطيف

Background and Objective: CTX-M type extended spectrum beta-lactamases is a rapidly expanding group of enzymes encountered with increasing fre quency, especially, in Escherichia coli (E. coli). There are a few reports on phylogenetic background of E. coli isolates from clinical sources of under five-year- old children in Iran. The purpose of this study was phylotyping of E. coli isolates having blaCTX-M and blaCTX-M-15 genes from under five-year- old children with diarrhea and urinary tract infection (UTI). Material and Methods: A total of 121 E. coli isolates (75 diarrheas and 46 UTI) were obtained and identified as E. coli based on standard bacteriological tests. DNA was extracted from E. coli isolates by alkaline lysis method. PCR assay was used because of high frequency of blaCTX-M and blaCTX-M-15 genes in the isolates and also determination of phylogenetic group/subgroups by detection of yjaA and chuA genes and fragment TspE4.C2. Results: The isolates belonged to four phylogenetic groups A (48.77%), B1 (14.04%), B2 (11.57%), and D (25.62%). In the diarrheic isolates,17.37% were positive for blaCTX-M and 14.04% of isolates possessed both blaCTX-M and blaCTX-15genes.Out of 46 UTI isolates, 21.73% were positive for blaCTX-M and 15.21% for blaCTX-M and blaCTX-M-15 genes. Conclusion: A rather high prevalence of E. coli isolates with blaCTX-M and blaCTX-M-15 genes was observed in fewer than five-year- old children in Khoramabad city. Phylotyping of isolates possessing blaCTX-M and blaCTX-15genes showed that most of them belonge to A and D phylo-groups. Keywords: Escherichia Coli, Phylogenetic Group, Extended-Spectrum Beta-Lactamase