تجزيه و تحليل ژنتيكي ناحيه سيتوكروم b در مرغ بومي خراسان

Genetic analysis of cytochrome b region in native chicken of Khorasan

حفظ تنوع ژنتيكي در جمعيت مرغان بومي به عنوان سرمايه ملي و كوچك بودن اندازه جمعيت آنها بسيار حايز اهميت است. بررسي توالي نوكليوتيدي ناحيه سيتوكروم b ميتوكندري در بين نژادها يا در درون آنها مي تواند شاخص مناسبي از ميزان تنوع موجود در جمعيت هاي مورد مطالعه باشد. هدف از پژوهش اخير، بررسي ژنتيكي و فيلوژنتيكي توالي نوكليوتيدي ناحيه سيتوكروم b از ژنوم ميتوكندري مرغ بومي خراسان است. بدين منظور از 5 قطعه مرغ بومي خراسان نمونه خون جمع آوري گرديد. پس از استخراج DNA، تكثير قطعه 858 جفت بازي ناحيه سيتوكروم b ميتوكندري توسط آغازگرهاي اختصاصي انجام گرفت. قطعات تكثير شده پس از خالص سازي به صورت رفت و برگشت توالي يابي شدند. تعداد 2 هاپلوتيپ مختلف بر اساس2 نوكليوتيد چند شكل موجود در توالي ها تعيين گرديد. توالي هاي نهايي بدست آمده از هر هاپلوتيپ با طول تقريبي780 جفت باز كه شامل 25/26 درصد آدنين، 57/13 درصد گوانين، 36/36 درصد سيتوزين،82/23 درصد تيمين بود. نتايج فيلوژنتيكي با استفاده از روش UPGM نشان داد، كه مرغ بومي خراسان در گروه مرغان آسيايي قرار مي گيرد و كمترين فاصله ژنتيكي با مرغ بومي چين دارد.

Maintain genetic diversity in population of native chickens is very important. They are as a national investment and the small size of their populations. Studying cytochrome b region of mitochondrial genome in between or within breeds can give useful information about genetic diversity of the population to be studied. The purpose of current study was genetic and phylogenetic investigate cytochrome b region of mitochondrial genome in native chicken of Khorasan. In order to, blood samples were collected from 5 native chicken of Khorasan. After extracting DNA, fragment 858 bp of cytochrome b region genome mitochondrial amplified by primers was designed and fragment amplified after purification was sequenced. Two different haplotypes were determined based on two single nucleotide polymorphism sequence and the final sequences of each haplotype with length approximate 780 bp which includes 26/25 % adenine, 13/57 % guanine, 36/36 % cytosine and 23/82 % thymine. Using the UPGM phylogenetic test results showed that the native chicken of Khorasan is in group of Asia chicken and has the lowest genetic distance with native chicken of china.