فراواني چند شكلي آلل rs8099917 مربوط به ژن اينترفرون لامبدا-3(IL-28B) در جمعيت ايراني

Distribution of rs8099917 IFN-λ3 (IL-28B) allele polymorphism in Iranian population

چكيده زمينه و هدف: (IL-28B)IFN-?3 يكي از سيتوكاين‎هاي جديد و عضوي از خانواده اينترفرون‎هاي تيپ III است. فعاليت‎هاي بيولوژيكي متعددي از آن در تنظيم سيستم ايمني، عملكردها در تومور و متاستاز و يا نقش در بيماري‎هاي ويروسي از جمله هپاتيت B و C نشان داده شده است. در اين مطالعه به بررسي ميزان فراواني پلي مرفيسم آلل rs8099917 در ژن IFN-?3 جمعيت ايراني مي‎پردازيم. مواد و روش‎ها: در اين مطالعه تجربي- آزمايشگاهي، پس از خون‎گيري از 118 نفر از افراد ايراني غير خويشاوند، استخراج DNA مطابق دستورالعمل كيت انجام شد. براي بررسي پلي مورفيسم آلل rs8099917 مربوط به ژن IFN-?3 از تكنيك Nested-PCR و روش RFLP با آنزيم‎هاي محدود الاثر BsrDI و Tsp45I استفاده گرديد. يافته‎ها: پس از انجام آزمون‎ها و جمع‎آوري داده‎ها فراواني واريانت‎ها به صورت ژنوتيپ GG، 5/2 درصد، ژنوتيپ GT، 4/31 درصد و ژنوتيپ TT، 1/66 درصد بود. آلل G، 22/18 درصد افراد و آلل T، 78/81 درصد افراد را در برمي‎گرفت. نتيجه‎گيري: نتايج اين مطالعه نشان مي‎دهد كه ژنوتيپ TT و آلل T فراواني غالب در پلي مورفيسم آلل rs8099917 در ژن IFN-?3 در جمعيت ايراني مي‎باشد. با توجه به عملكردهاي مختلفي كه براي IFN-?3 نشان داده شده است، مشخص شدن فراواني اين واريانت مي‎تواند راهگشا و كمك كننده به بسياري از مطالعات، طراحي و بررسي‎ها و هم‎چنين راهكارهاي درماني در افراد ايراني در بيماري‎هايي نظير تومور و هپاتيت باشد. واژگان كليدي: آللrs8099917، افراد ايراني، اينترفرون لامبدا سه، پلي مورفيسم

Abstract Background: IFN-?3 (IL-28B) is a new cytokine from the type III interferons. Its role in several biologic activities, such as regulation of immune responses, tumor and metastasis, or its functions in HBV and HCV diseases, has been shown. The present study evaluated the frequency of rs8099917 allele polymorphism in IFN-?3 gene in Iranian population. Materials and Methods: In this laboratory-experimental study, after collecting blood samples from 118 unrelated Iranian subjects, DNA extraction was performed according to the kit protocols. Evaluation of rs8099917 allele polymorphism was done by Nested-PCR and RFLP method using BsrDI and Tsp451 restriction enzymes. Results: After running the tests and data analysis, the frequencies of GG genotype (2.5%), GT genotype (31.4%), and TT genotype (66.1%) were obtained. Allele frequencies were 71.22% for G allele and 81.78% for T allele. Conclusion: The results of this study showed that TT genotype and T allele are the dominant frequencies of rs8099917 allele of IFN-?3 gene in Iranian population. Regarding the different established functions of IFN-?3, frequency determination of this variant can be helpful in different studies, designs, evaluations, and treatment procedures in some diseases, such as tumors and hepatitis, in Iranian patients. Keywords: IFN-?3, Iranian population, polymorphism, rs8099917 allele