بررسي الگوي متيلاسيون ژن x ويروس هپاتيت B در افراد آلوده

Methylation Pattern of Hepatitis B Virus X Gene in Infected Patients

هدف: يكي از حوزه‏هاي مهم در اپي‏ژنتيك، متيلاسيون DNA است كه دي نوكليوتيدهاي CpG در ژنوم را تحت تاثير قرار داده و رونويسي بيان ژن‏هاي مورد نظر را كنترل مي‏كند. در ژنوم ويروس هپاتيت B، سه جزيره غني از دي نوكليوتيد CpG وجود دارد كه تمايل شديدي به متيله شدن دارد. هدف از اين مطالعه تعيين الگوي متيلاسيون ژن x ويروس هپاتيت B در بيماران مبتلا به اين ويروس است. مواد و روش‏ها: جمعيت هدف بررسي در اين مطالعه 45 بيمار مبتلا به ويروس هپاتيت B بود. ابتدا DNA ژنومي ويروس براي تعيين ميزان متيلاسيون با بي‏سولفيت سديم تيمار شد. سپس با دو گروه آغازگر متيله و غير متيله توسط روش MSP تجزيه و تحليل شد. نتايج: ميزان متيلاسيون در نمونه‏هاي سرمي مبتلا به ويروس به طور كلي 5/35 درصد بود و اين نرخ در بيماران HBeAg مثبت 8/20 درصد و در مبتلايان HBeAg منفي 3/52 بود. به اين ترتيب ميزان متيلاسيون در نمونه سرمي افراد مبتلابه هپاتيت B مزمن HBeAg منفي به طور معني‏داري بيشتر از ميزان متيلاسيون DNA ويروس در افراد مبتلا HBeAg مثبت است كه اين فرضيه با Student T-test با 02/0=P تاييد شد. نتيجه‏گيري: متيلاسيون ژنوم هپاتيت B مي‏تواند به عنوان يك مكانيسم جديد براي كنترل پيشرفت عفونت ويروسي و همچنين تعيين مرحله باليني بيماري مبتلا در نظر گرفته شود، بنابراين دانستن الگو‏هاي مختلف متيلاسيون DNA از اهميت ويژه‏اي برخوردار است. در اين مطالعه ميزان متيلاسيون در بيماران HBeAg منفي به طور معني‏داري بالاتر از افراد HBeAg مثبت تعيين شد (02/0=P).

Objective: A recent field of research in epigenetics is DNA methylation which involves the CpG island in the genome that subsequently controls transcription and translation of targeted genes. In the hepatitis B virus (HBV) genome, there are three CpG islands which tend to be methylated. The aim of the current study is to determine the methylation pattern of the HBV X gene in chronically infected HBV patients. Methods: Study participants comprised 45 chronically infected HBV patients. According to the presence of the HBeAg, patients were divided into two groups, HBeAg positive (n=24) and HBeAg negative (n=21). Initially, viral DNA was treated with natrium bisulfate. Then, analysis was performed with two sets of methylated and non-methylated primers by the MSP method. Results: The overall methylation rate in serum samples of hepatitis B infected patients was 35.5%; the rate in the HBeAg positive patients was 20.8%, whereas it was 52.3% in HBeAg negative patients. There was a significantly higher rate of methylation in serum samples of HBeAg negative patients compared to HBeAg positive patients (studentʹs t-test; P=0.02). Conclusion: Methylation of HBV can be used as a new mechanism to control the progression of viral infection. This methodology can be useful for determining the characteristics of clinical stages of this infection.