عنوان مقاله :
انگشت نگاري ژنومي مايكوباكتريوم توبركلوزيسهاي جدا شده از بيماران سل ريوي استان مركزي به روش PGRS-RFLP
عنوان فرعي :
DNA fingerprinting of Mycobacterium tuberculosis isolates of pulmonary tuberculosis patients in Markazi province by PGRS-RFLP method
پديد آورندگان :
رفيعي، بهنام نويسنده كارشناس ارشد ميكروبيولوژي، گروه ميكروبيولوژي، دانشگاه آزاد اسلامي، واحد قم، قم، ايران Rafiee, behnam , مصوري، نادر نويسنده استاديار، موسسه واكسن و سرم سازي رازي، بخش توليد و تحقيق توبركولين و مالئين، كرج، ايران Mosavari, nader , فرازي، علي اصغر نويسنده استاديار، متخصص عفوني، گروه بيماريهاي عفوني و گرمسيري، دانشگاه علوم پزشكي اراك، اراك، ايران Farazi, ali asghar , نظري، راضيه نويسنده استاديار، دكتراي ميكروبيولوژي، گروه ميكروبيولوژي، دانشگاه آزاد اسلامي، واحد قم، قم، ايران Nazari, razyeh , كشاورز، روح اله نويسنده كارشناس ارشد، موسسه واكسن و سرم سازي رازي، بخش توليد و تحقيق توبركولين و مالئين، كرج، ايران Keshavarz, roohollah , تدين، كيوان نويسنده استاديار، موسسه واكسن و سرم سازي رازي، بخش توليد و تحقيق توبركولين و مالئين، كرج، ايران Tadayon, keyvan
اطلاعات موجودي :
فصلنامه سال 1391 شماره 65
كليدواژه :
انگشت نگاري ژنومي , DNA fingerprinting , Mycobacterium tuberculosis , RFLP , reactivation , فعاليت مجدد عفونت , مايكوباكتريوم توبركلوزيس
چكيده فارسي :
چكيده
زمينه و هدف: سل معضلي قديمي است كه هم اكنون به عنوان چالشي جديد مطرح شده و با توجه به همسايگي ايران با دو كشور افغانستان و پاكستان كه در زمره 22 كشور داراي بيشترين شيوع سل در دنيا هستند ضرورت توجه بيش از پيش ما را به اين بيماري متذكر ميكند. بنابر اين به منظور آگاهي از اپيدميولوژي مولكولي سل و بررسي ميزان تنوع ژنتيكي سويههاي مايكوباكتريوم توبركلوزيس در استان مركزي، مطالعه حاضر انجام پذيرفت.
مواد و روشها: در اين مطالعه تجربي تعداد 57 نمونه خلط از بيماران سل ريوي اسميرمثبت مراجعه كننده به مركز بهداشت و درمان استان مركزي، برروي محيطهاي اختصاصي كشت داده شدند. سپس DNA ژنوميك جدايهها طبق پروتكل استاندارد سازمان بهداشت جهاني استخراج گرديد و با استفاده از روش PCR تعلق اين جدايهها به كمپلكس مايكوباكتريوم توبركلوزيس تاييد گرديد، سپس DNA ژنوميك توسط آنزيمهاي PvuII و AluI مورد هضم آنزيمي قرار گرفت و محصول هضم، الكتروفورز شده و قطعات DNA از طريق ساترن بلاتينگ به غشا نايلوني با شار‍‌ژ مثبت منتقل گرديدند و سپس هيبريداسيون با پروب PGRS انجام پذيرفت. در خاتمه قطعات هيبريد شده با استفاده از واكنش آنزيمي شناسايي و مورد آناليز قرار گرفتند.
يافتهها: در طي تايپينگ اين جدايهها به روش RFLP، با استفاده از دو آنزيم PvuII و AluI و پروب PGRS، گستره وسيعي از تنوع ژنتيكي نمايان گرديد به طوري كه به ترتيب 50 و 45 تيپ ژنتيكي شناسايي شد.
نتيجهگيري: با توجه به تنوع بالاي PGRS در سويههاي مايكوباكتريوم توبركلوزيس ميتوان نتيجهگيري كرد كه در جمعيت مورد بررسي اكثر افراد با منشا متفاوت به بيماري سل مبتلا شدهاند، بنابراين فعال شدن مجدد عفونت نقش بيشتري را در گسترش بيماري سل در استان مركزي داشته است.
واژگان كليدي: انگشت نگاري ژنومي، فعاليت مجدد عفونت، مايكوباكتريوم توبركلوزيس، RFLP
چكيده لاتين :
Abstract
Background: Tuberculosis is an old problem that is currently considered a great challenge. Noticing Iran’s borders with Afghanistan and Pakistan, which are among the 22 high burden countries around the world, the present study was conducted to analyze the current molecular epidemiology of tuberculosis and survey genetic diversity of Mycobacterium tuberculosis strains in Markazi province, Iran.
Materials and Methods: In this experimental study, 57 sputum specimens from smear positive patients admitted to health centers in Markazi province were cultured on specific mycobacterial culture media. Genomic DNA was extracted by standard protocols of WHO and digested separately by PvuII and AluI. Electrophoresis was performed and DNA fragments were transferred to positively charged nylon membrane by southern blotting method and hybridization by PGRS probe. The hybridized strains were subsequently detected by enzymatic reaction and analyzed.
Results: Genotyping of the isolates by PGRS-RFLP with Pvu II and AluI displayed a wide range of genetic diversity so that 50 and 45 genotypes were identified, respectively.
Conclusion: Noticing the great diversity of PGRS in the Mycobacterium tuberculosis strains, it can be concluded that in the study population, the majority of the patients had tuberculosis with different etiologies. Therefore, it seems that reactivation of latent infection has had the main role in the spread of tuberculosis.
Keywords: DNA fingerprinting, Mycobacterium tuberculosis, Reactivation, RFLP
عنوان نشريه :
مجله دانشگاه علوم پزشكي اراك
عنوان نشريه :
مجله دانشگاه علوم پزشكي اراك
اطلاعات موجودي :
فصلنامه با شماره پیاپی 65 سال 1391
كلمات كليدي :
#تست#آزمون###امتحان
