بررسي تنوع ژنوتايپي سويه هاي سالمونلا تايفي موريوم با استفاده از روش ERIC-PCR

Determining of the Variety of Genotypes in Salmonella Typhimurium by ERIC-PCR

سابقه و هدف: سالمونلا انتريكا سرووار تايفي موريوم يكي از شايع ترين سرووارهايي است كه در سراسر دنيا از نمونه هاي آلوده به سالمونلا جداسازي مي شود. تايپينگ مولكولي سرووارهاي سالمونلا، اهميت اپيدميولوژيك دارند. اين مطالعه به منظور بررسي تنوع ژنوتايپي سويه هاي سالمونلا تايفي موريوم بر اساس واكنش زنجيره اي پلي مرازي مناطق بين ژني تكراري حفاطت شده انتروباكترياييEnterobacterial Repetitive Intergenic Consensus (ERIC-PCR) انجام شد. مواد و روشها: در اين مطالعه مقطعي، طي سال هاي 1386 لغايت 1388، نمونه هاي باليني از بيماران مراجعه كننده به سه بيمارستان مختلف شهر تهران جمع آوري شد. جداسازي ايزوله هاي سالمونلا از طريق كشت بر روي محيط هاي كشت مناسب انجام گرفت و سروتايپينگ سويه ها با استفاده از آنتي سرم هاي تجاري در دسترس صورت پذيرفت. سرانجام تنوع ژنتيكي سويه ها با استفاده از روش ERIC-PCR تعيين شد. يافته ها: از مجموع 650 نمونه باليني مورد مطالعه، تعداد 21 مورد بر اساس تست هاي ميكروبيولوژي و سروتايپينگ، سالمونلا تايفي موريوم تشخيص داده شدند. با استفاده از روش ERIC-PCR، سويه هاي سالمونلا تايفي موريوم به 9 الگوي ژنوتيپي (T1-T9) طبقه بندي شدند كه 33% از سويه ها متعلق به الگوي T1 (7 سويه) بودند و به دنبال آن 6 سويه (29%) در الگوي T2، 2 سويه (10%) در الگوي T3 و يك سويه در الگوهاي T4 تا T9جاي گرفتند. نتيجه گيري: نتايج اين مطالعه نشان داد كه سويه هاي اندميك سالمونلا تايفي موريوم جداسازي شده در تهران داراي الگوهاي متنوع ژنتيكي هستند و ERIC-PCR، روش مناسب تايپينگ جهت اهداف اپيدميولوژيك سالمونلا تايفي موريوم مي باشد.

BACKGROUND AND OBJECTIVE: Salmonella enterica serovar Typhimurium is one of the most prevalent Salmonella serovars worldwide. Molecular typing of Salmonella serovars is of epidemiologic importance. The current research was carried out to study the genetic diversity of Salmonella typhimurium by enterobacterial repetitive intergenic consensus polymerase chain reaction (ERIC-PCR). METHODS: In a cross-sectional descriptive study that was carried out from 2007 to 2009, clinical samples including stool and blood were collected from the patients admitted to three hospitals in Tehran, Iran. All Salmonella stains were cultured and diagnosed by standard microbiological methods. Serotyping was carried out by commercially available antisera and the genetic diversity between the strains was determined by ERIC-PCR. FINDINGS: Among 650 clinical samples, twenty one salmonella typhimurium were identified. ERIC-PCR differentiated Salmonella typhimurium strains into nine genetic clusters (T1-T9). Thirty three percent of the strains were clustered into T1 (7 isolates) followed by T2 (6 strains, 29%), T3 (2 strains, 10%) and T4-T9 (each one strain). CONCLUSION: The results showed that endemic Salmonella typhimurium strains isolated in Tehran could be attributed to divers ERIC clusters and ERIC-PCR has been evaluated as a good approach for molecular typing of Salmonella typhimurium strains. KEY WORDS: Salmonella typhimurium, ERIC-PCR, Genotype patterns.