بررسي روابط ژنتيكي توده هاي آويشن به وسيله نشانگر DNA چندشكل تكثيرشده تصادفي (RAPD)

Survey of Genetic Relationships in Thymus Accessions, Using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) Marker

آويشن (Thymus sp.)، كه معمولاً به عنوان گياه دارويي شناخته مي شود، در نواحي مختلف ايران يافت مي گردد. آناليز روابط ژنتيكي در ميان گونه ها جهت فهم فرايند تكامل در سطح جمعيت و در سطــح ژنوم ضــروري است. فن آوري هاي نشـانگر مولكولي پيشـرفت قابل توجهي داشته اند و تاثير زيادي در يافتن اساس تنوع ژنتيكي دارند. در اين مطالعه 70 توده جمع آوري شده از مناطق مختلف ايران، به وسيله 30 آغازگر RAPD آناليز شدند. بعد از استخراج DNA و انجام PCR با استفاده از آغازگرهاي مختلف در كل 407 باند تكثير شد كه 320 باند چندشكلي نشان داد. ميانگين ميزان اطلاعات چندشكلي در توده هاي مورد بررسي 34/0 محاسبه شد كه آغازگر D13 داراي بيش ترين ميزان PIC و آغازگر B04 داراي كمترين ميزان PIC بود. ماتريس تشابه حاصل از ضريب جاكارد و دندوگرام حاصل از تجزيه خوشه اي به روش UPGMA ترسيم گرديد. نتايج به دست آمده از تجزيه به مولفه هاي اصلي و تجزيه به مختصات اصلي با نتايج حاصل از تجزيه خوشه اي مطابقت داشت. فواصل ژنتيكي كه به وسيله نشانگر RAPD در اين تحقيق برآورد گرديد، مي تواند اطلاعات باارزشي براي انجام مطالعات و كارهاي اصلاحي روي اين گياه باارزش دارويي به دست دهد.

Thymus sp., commonly known as medical plant, is found in the different regions of Iran. Analysis of genetic diversity within species is vital for understanding evolutionary processes at the population and genomic level. Molecular marker technologies are the most advanced and, possibly, the most effective means for understanding the basis of genetic diversity. In the present study, 70 accessions collected from different districts of Iran were analyzed, using 30 RAPD primers. After DNA extracting, PCR performed using different primers. Totally, of amplified 407 bands, 320 bands were polymorphic corresponding to 78.62% polymorphism across the accessions. The average of polymorphism information content (PIC) was 0.34 and D13 and B04 primers had the highest and lowest PIC value, respectively. The UPGMA-based dendrogram constructed among the 70 accessions depends on the similarity matrix results. Results of Principal component analysis confirmed the results of cluster analysis. Assessment of genetically distances using RAPD marker could revealed important information for breeding and improvement of this plant.