بررسي آلودگي برخي انواع آب ميوه به باكتري آليسايكلوباسيلوس اسيدوترستريس با استفاده از روش PCR و RFLP

A survey on bacterial contamination of fruit juice with Alicyclobacillus acidoterrestris using PCR and RFLP

آليسايكلوباسيلوس باكتري اسپوردار و مقاوم به گرماست كه موجب تغيير مزه و بوي آب ميوه مي شود و خسارات قابل توجهي را به صنايع آب ميوه سازي وارد مي سازد. هدف از اين تحقيق شناسايي اين باكتري از آب ميوه هاي مختلف با واكنش زنجيره اي پلي مراز با استفاده از پرايمرهاي اختصاصي بود. براي اين منظور، پس از انتقال به محيط كشت و گرم خانه گذاري، استخراج DNA و واكنش زنجيره اي پلي مراز بر روي نمونه ها صورت گرفت. نتايج حاكي از آلودگي 5 نمونه از مجموع 24 نمونه بررسي شده بود. پس از برش با آنزيم EcoR1 و انجام الكتروفورز باندهايي واضح در نواحي 118 و 528 جفت بازي مشاهده شد كه اين حالت مطابق با الگوي RFLP حاصل از باكتري آليسايكلوباسيلوس اسيدوترستريس مي باشد. با توجه به نتايج اين تحقيق مي توان بيان كرد كه آلودگي به اين باكتري در صنايع توليد آب‌ميوه مشكل ساز است و براي تشخيص آن تكنيك PCR با دقت بالا، موجب كاهش هزينه ها و صرفه-جويي در زمان مي شود.

Alicyclobacillus is an endospore forming and heat resistant bacterium that can cause changes in odor and color of fruit juice and make significant losses to juice industries. The purpose of this study was to identify this bacterium from different juices by PCR using specific primers. To do so, DNA extraction and PCR was done after culture and incubation. Of 24 tested samples, 5 cases were examined. As a consequence of enzymatic digestion with EcoR1 and electrophoresis, 118 and 528 bp fragments were obtained that are in accordance with RFLP pattern of Alicyclobacillus acidoterrestris. With regard to the obtained results, it can be claimed that contamination to this bacterium makes some problems in fruit juice industry. To diagnosis it better, PCR with high sensitivity can be used since it reduce the expenditures and save the time.