بررسي مقدماتي فيلوژني و ساختار ژنتيكي ميگوي موزي (Fenneropenaeus merguiensis) در خوريات لافت و سيريك خليج فارس با استفاده از توالي‌يابي ژن ميتوكندريايي 16S rRNA

Primary study of phylogeny and genetic structure of Banana shrimp Fenneropenaeus merguiensis in Laft and Sirik estuaries in the Persian Gulf using mitochondrial 16S rRNA gene sequencing

ميگوی موزی با نام علمی Fenneropenaeus merguiensis از مهم‌ترين گونه‌های ميگو در خليج فارس است كه حدود 60 درصد از صيد ميگوی استان هرمزگان را تشكيل می‌دهد. با توجه به اهميت اين گونه در چرخه صيد و صيادی، فيلوژنی و ساختار ژنتيكی جمعيت اين گونه در خوريات لافت و سيريك خليج فارس با روش توالی‌يابی ژن ميتوكندريايی 16S rRNA بررسی شد. نتايج توالی‌يابی ژن 16S rRNA 10 ميگوی نمونه‌برداری شده كه شامل 448 باز هم‌رديف شده بود، يك جايگاه ژنی مونومورف، 447 جايگاه ژنی پلی‌مورف و 7 هاپلوتيپ نشان داد. هيچ گونه چند شكلی اضافه و حذف مشاهده نشد. مقدار F-statistic در سطح اطمينان 95 درصد بين دو جمعيت ميگوی خوريات لافت و سيريك (برابر با 14/0) معنی‌دار نبود (08/0 = P value). ترسيم درخت‌های تكاملی ساختار جغرافيايی مشخصی را بين دو منطقه نشان نداد. ميانگين مقدار آزمون تاجيما و Fuʹs FS بين دو جمعيت (به ترتيب برابر با 61/2 و 33/10) معنی‌دار نبود كه مؤيد عدم بسط جمعيتی بين نمونه‌های دو منطقه است. ميزان تنوع هاپلوتيپی و نوكلئوتيدی نمونه‌های دو منطقه به ترتيب 004/0 ± 933/0 و 802/0 ± 672/0 محاسبه شد. نتايج پژوهش حاضر نشان داد كه F. merguiensis در خوريات لافت و سيريك از تنوع ژنتيكی بالايی برخوردار است اما با توجه به ميزان شاخص جدايی جمعيت و حد معنی‌دار بودن، نمی‌توان با يقين جمعيت‌ها را يكی دانست. نتايج تحقيق حاضر می‌تواند در مديريت شيلاتی مبتنی بر بازسازی ذخاير و حفظ تنوع ژنتيكی هريك از جمعيت‌ها مدنظر قرار گيرد.

Banana shrimp Fenneropenaeus merguiensis is one of the most important shrimp species in the Persian Gulf compromising about 60% of total shrimp catch in Hormozgan Province. Regarding the importance of banana shrimp in fisheries industry, phylogeny and genetic structure of the population of this in Laft and Sirik estuaries in the Persian Gulf was investigated using mitochondrial 16S rRNA gene sequencing. Results of 16S rRNA gene sequencing of 10 shrimps including 448 aligned base pairs yielded one monomorphic locus, 447 polymorphic loci and seven haplotypes. No insertions and deletions were observed. F- statistic parameter at 95% level of confidence was 0.14 and was not significant between the two populations (P value= 0.08). Phylogenetic trees did not show a differentiated geographical structure between the two regions. Mean values of Tajima’s D and Fu’s Fs between the regions were 2.61 and 10.33, respectively. Insignificant values of these tests are indicative of no expansion of F. merguiensis population between the two regions. Haplotype and nucleotide diversity of the shrimps were 0.933 ± 0.004 and 0.802 ± 0.672, respectively for the two regions. The results of this study revealed that F. merguiensis populations of Laft and Sirik estuaries had high levels of genetic diversity but regarding the value of F- statistic parameter and its significance level, the existence of genetically similar populations could not be deducted with high level of confidence. The results of present study could be considered in fisheries management for restocking programs and conservation of genetic diversity of populations.