بررسي چندشكلي ژنوتيپ هاي مركبات با استفاده از نشانگر مولكولي رپيد

Assessment of polymorphism in citrus genotypes using RAPD molecular markers

شناسايي تنوع ژنتيكي و روابط خويشاوندي، براي دستيابي به ارقام مطلوب در مركبات مهم و ضروري است. در اين پژوهش از نشانگر RAPD جهت تعيين تنوع ژنتيكي ميان 23 ژنوتيپ مركبات استفاده شد. يا 13 آغازگر استفاده شده تعداد 242 باند چند شكل ايجاد گرديد كه بيشترين باند تكثير شده 13 عدد و مربوط به آغازگر OPA-07 بود، در حاليكه آغازگر 05 - OPA با هشت باند كمترين قطعات چندشكل را نشان داد. متوسط تعداد باند چندشكل براي هر آغازگر 13 باند برآورد گرديد. تجزيه دادهها توسط نرمافزار NTsys با استفاده از ضريب تشابه جاكارد، ميزان تشابه محاسبه شده بر 0 نشان داد. تجزيه / 0 با ميانگين تشابه 22 / 0 تا 39 / اساس باندهاي چندشكل را در دامنهاي از 14 خوشهاي بر پايه ماتريس تشابه جاكارد و با روش UPGMA صورت گرفت. بر اساس تجزيه 0 ژنوتيپهاي مركبات مورد مطالعه به پنج گروه تقسيم شدند. بر / خوشهاي، در ضريب تشابه 43 0( مربوط به دو ژنوتيپ پوملو و نارنگي محلي و بيشترين / اساس ماتريس تشابه، كمترين شباهت ) 14 0( مربوط به دو تيپ طبيعي ناشناخته / شباهت ) 39 G74 و G73 بود. با بررسي دندروگرام نشان داده شد كه پوملو و نارنگي بهعنوان گونههاي حقيقي مركبات در خوشههاي مجزا قرار دارند. تعيين تنوع ژنتيكي در مركبات، اطلاعات مفيدي را براي برنامههاي بهنژادي، انتخاب و حفظ ارقام فراهم ميكند.

It is important to identify the genetic diversity and phylogenic relationships for achieving desirable citrus cultivars. In present study RAPD markers were used to determine genetic diversity among 29 citrus genotypes. From 19 used primers, 248 polymorphic bands were amplified. Primers OPA-07 and OPA-05 (with 19 and 8 amplified bands), produced maximum and minimum polymorphic bands, respectively. The average number of polymorphic bands was estimated as 13 for each primer. Similarity among samples was calculated using NTsys software and Jaccard coefficient. Rang of similarity was 0.14-0.97 based on polymorphic bands with average of 0.62. Cluster analysis has been done based on Jaccardʹs similarity matrix and the UPGMA method. Cluster analysis has divided citrus genotypes into five separate groups. According to the similarity matrix results, the lowest similarity (0.14) was belonged to local mandarin and Pommelo and the highest similarity (0.97) was belonged to unknown natural types G74 and G73. In current research, Pommelo and mandarin confirmed as true species of citrus in distinct cluster. Determination of genetic diversity in citrus provides useful information for breeding programs, selection and improving cultivars.