بررسي ساختار ژنتيكي صدف مرورايد ساز لب سياه Pinctada sp. persica با استفاده از توالي يابي ژن سيتوكروم اكسيداز I ميتوكندري در خليج فارس

بررسي ساختار ژنتيكي صدف مرورايد ساز لب سياه Pinctada sp. persica با استفاده از توالي يابي ژن سيتوكروم اكسيداز I ميتوكندري در خليج فارس

در اين پژوهش به منظور بررسي ساختار ژنتيكي صدف مرورايد ساز لب سياه در خليج فارس 12 نمونه از سه ايستگاه)لارك،شيدور و )COI( توالي يابي ژن سيتوكروم اكسيداز ميتوكندري CTAB به روش DNA خارك(صيد گرديد و قطعه اي از مانتل هر نمونه در اتانول 39 درصد قرار داده شد. استخراج انجام گرفت و واكنش زنجيره اي پلي مراز با يك جفت پرايمر انجام گرفت. بعد از توالي يابي، الاين كردن سكانس ها صورت گرفت، تعداد هاپلوتايپ ها، فراواني هاپلوتايپي، تنوع نوكليوتيدي با نرم افزارهاي CLUSTAL_W با نرم افزار انجام شد. MEGA و ترسيم درخت فيلوژني با نرم افزار GC محاسبه گرديد. همچنين درصد DNAsp و Areliquien نتايج حاصل از اين بررسي نشان داد كه صدف لب سياه گونه خليج فارس فاقد تمايز ژنتيكي و داراي يك جمعيت 4/ داراي مقدار 299 P. margaritifera cumingii واحد مي باشد. فاصله زنتيكي اين گونه با زير گونه پلي نزي به مقدار P. margaritifera cumingii و Pinctada mazatlanica مي باشد كه اين مقدار، از فاصله بين دو گونه 4( بدست / 4/410 بيشتر است و فاصله ژنتيكي بين صدف لب سياه خليج فارس با زير گونه آفريقايي نيز مقدار ) 410 در يك كلاد قرار نمي گيرد Pinctada margaritifera cumingii آمد. بنابراين صدف لب سياه خليج فارس با زير گونه است. Pinctada margaritifera و به احتمال زياد گونه جديدي، متفاوت از گونه

In this study, genetic stock structure of the black-lipped pearl oyster (Pinctada sp. Persica) was examined using mtDNA Cytochrome Oxidase I sequencing (COI) across Persian Gulf. For this reason, 28 samples were collected from three stations (Larak, Shidvar, and Khark). Total genomic DNA was extracted using DNA extraction methods and amplification of the selected fragments was undertaken. Analysis of sequencing was carried out using Bioedite and Clustal-W. Total number of haplotypes, nucleotide diversity and haplotype frequencies were calculated using DNAsp and Areliquien softwares. In order to construct the phylogenetic tree, MEGA was undertaken. Results of analysis suggested that there is low genetic variability between sampled black-lipped oysters. Therefore, there is most probably a single population of black-lipped species across Persian Gulf. Comparison of this research with available data from other studies showed that genetic distance between black-lipped species and sub-species P. margaritifera cumingii is 0.136 while the distance between Pinctada mazatlanica and P. margaritifera cumingii (0.027) was lower. On the other hand, the genetic distance between the Persian Gulf black-lipped oyster and the African sub-species is 0.027. Hence, results of this study suggested that the Persian Gulf black-lipped oyster does not go under the same category with P. margaritifera cumingii. Therefore, the studied species could probably be a new species different from the Pinctada maragritifera in Persian Gulf area.