ارزيابي روابط ژنتيكي بين 36 ژنوتيپ از گونه هاي كلزا (Brassica sp.) با استفاده از نشانگر مولكولي ISSR

Assessment of Genetic Relationships Among 36 Brassica Genotypes using ISSR Molecular Markers

مطالعه روابط ژنتيكي، پيش نيازي براي اصلاح گياهان زراعي و هم چنين پيش نيازي براي حفظ و نگهداري منابع ژنتيكي است. با توجه به اينكه كلزاي هيبريد عملكرد بيشتري از لاين هاي اينبرد دارد، لزوم تعيين تنوع ژنتيكي در اين گياه از اهميت ويژه اي برخوردار است در اين مطالعه تنوع ژنتيكي 36 ژنوتيپ جنس Brassica با استفاده از 13 نشانگر ISSR مورد ارزيابي قرار گرفت. در مجموع 267 قطعه تكثيري امتيازدهي شدند كه از اين تعداد 257 مكان چند شكلي (38/96%) نشان دادند. ميانگين PIC و MI به ترتيب 34/0 و 48/6 بدست آمد. آغازگرISSR16 بالاترين مقدار PIC، 4/0 را نشان داد. نتايج نشان داد كه ميانگين شاخص هاي نشانگري شامل تنوع ژنتيكي ني، ضريب شانون، تعداد آلل موثر به ترتيب 34/0، 51/0، 58/1 مي باشد. ترسيم تجزيه خوشه اي با استفاده از ضريب تشابه جاكارد و الگوريتم UPGMA ژنوتيپ هاي مورد بررسي را به 3 گروه و3 گروه فرعي تفكيك نمود كه حاكي از گروه بندي بر اساس دو سطح پلوييدي، تتراپلوييد و ديپلوييد مي باشد. تنوع ژنتيكي نشان داده شده بوسيله نشانگرISSR در اين پژوهش نشان دهنده اين است كه اين نشانگر ميتواند براي شناسايي تفاوت هاي بين گونه اي و همچنين داخل گونه اي در مطالعات فيلوژنتيكي استفاده شود و به منظور بررسي دقيق تر روابط و ساختار ژنتيكي ژنوتيپ هاي كلزا همزمان با بكارگيري صفات مورفولوژيكي پيشنهاد مي شود.

Study of genetic relationships is a prerequisite for plant breeding activities as well as for conservation of genetic resources. Since the hybrid canola have more yield than inbred lines, determine the genetic diversity of this have particular importance. In the present study, genetic diversity among 36 genotype of Brassica sp. were determined using inter simple sequence repeat (ISSR) markers. Thirteen selected primers produced 267 discernible bands, with 257 (96.38%) being polymorphic, indicating considerable genetic diversity among genotypes. Average PIC and MI of all primers were 0.34 and 6.48, respectively. The results showed that average of marker index including Nei’s gene diversity, Shannon’s information index, the effective number of alleles were 0.34, 0.51, 1.58 respectively in genotypes of Brassica. Based on an un-weighted pair-group method using arithmetic average (UPGMA) clustering algorithm, three distinct groups were established. Genetic diversity shown by the marker ISSR, indicates that these markers can be used to identify differences between species and within species, In studies of phylogenetic. In order to evaluate the relationships and genetic structure of genotype canola using morphological characteristics is proposed.