ارزيابي تنوع ژنتيكي بين و درون تيپ هاي مختلف توتون با استفاده از نشانگرهاي IRAP و REMAP

Assessment of Genetic Diversity Among and Within Different Types of Tobacco (Nicotianatabacum L.) Using IRAP and REMAPMarkers

در اين مطالعه به منظور بررسي تنوع ژنتيكي 45 ژنوتيپ از ژرم پلاسم تيپ هاي مختلف توتون شامل گرمخانه اي، بارلي و شرقي، از 20 تركيب آغازگري IRAP و REMAP استفاده شد كه از بين اين آغازگرها، 5 آغازگر IRAP و 9 آغازگر REMAP قادر به توليد الگوي نواري، با وضوح و چندشكلي بالا بودند و در مجموع 188 مكان را تكثير كردند كه از اين تعداد 153 مكان، چندشكل بودند. آغازگر RTR-10 با 22 نوار و RTR-1 با 16 نوار، بيشترين و آغازگر UBC817+RTR1 با 4 نوار، كمترين تعداد مكان هاي چند شكل را تكثير كردند. ميزان اطلاعات چندشكل نشانگرها بين 16/0 تا 33/0 و شاخص نشانگر از 34/0 تا 25/6 در كل ژنوتيپ هاي مورد مطالعه متغير بود. تجزيه خوشه اي به روش UPGMA، 45 ژنوتيپ مورد مطالعه را در پنج گروه قرار داد، كه گروه اول شامل تيپ بارلي، گروه دوم شامل تيپ گرمخانه اي و گروه هاي 3، 4 و 5 شامل ژنوتيپ هاي شرقي شدند. صحت گروه بندي حاصل از تجزيه خوشه اي توسط تابع تشخيص كانوني به روش خطي فيشر 3/73 درصد تاييد شد.

In present study IRAP and REMAP markers were used to assess genetic diversity levels in 45 genotypes of different types of tobacco germplasm, including burley, flue-cured and oriental tobacco that out of 20 composition primers, 5 IRAP primersand 9 REMAP primers produced scorable and polymorphic banding patterns. Totally from 188 amplified loci, 153 loci were polymorph. RTR-10 and RTR-1 with 22 and 16 bands andUBC817+RTR-1 with 4 bands had the maximum and minimum polymorphic bands, respectively. In overall studied genotypes, PIC value varied between 0.16 to 0.33 and MI between 0.34 to 6.25. Cluster analysis using UPGMA method, 45 genotypes were placed in five cluster groups. GroupsI, II and III to V including burley type, flue-cured tobacco and oriental tobacco genotypes, respectively.Canonical Discriminate Function via Fisherʹs linear method was ableto confirm 73.3 percent of the validity of clustering analysis result.