عنوان مقاله :
بررسي بيوانفورماتيكي به‌منظور يافتن ميكروRNA مهار كننده مسير PI3K/AKT و ارزيابي در رده‌هاي سلولي سرطان پروستات
عنوان فرعي :
Bioinformatic Evaluations for Locating the microRNA Suppressing PI3K/AKT Pathway and Analysis in Prostate Cancer Cell Lines
پديد آورندگان :
آقايي بختياري، سيد حميد نويسنده دانشجوي كارشناسي ارشد بيوتكنولوژي پزشكي ـ دانشگاه تربيت مدرس ـ تهران ـ ايران Aghaii Bakhtiari, .S.H , عارفيان، احسان نويسنده PhD ويروس‌شناسي پزشكي ـ استاديار دانشكده زيست‌شناسي دانشگاه تهران ـ تهران ـ ايران Arefian, .E , سليماني، مسعود نويسنده Associate Professor, Department of Hematology, Faculty of Medical Sciences, Tarbiat Modares University, Tehran, Iran Soleimani, , Masoud , ميراب سميعي، سيامك نويسنده آزمايشگاه هاي تحقيقاتي كنترل غذا و دارو- تهران , , نوربخش، فرشيد نويسنده Assistant Professor, Department of Immunology, Faculty of Medicine, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran Noorbakhsh, Farshid , مهديان، رضا نويسنده هيات علمي انستيتو پاستور ايران -, - , فرد اصفهاني، پژمان نويسنده Assistant Professor, Department of Biochemistry, Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran Fard-Esfahani, Pezhman
اطلاعات موجودي :
فصلنامه سال 1393 شماره 0
كليدواژه :
Bioinformatics Prediction , PI3K/Akt pathway , پيش‌بيني بيوانفورماتيكي , prostate cancer , مسير PI3K/AKT , miR-29 Family , خانواده miR-29 , سرطان پروستات
چكيده فارسي :
هدف: سرطان پروستات دومين سرطان شايع و پنجمين عامل مرگ ناشي از سرطان مردان در سال 2012 در جهان است. مسير PI3K/AKT نقش اساسي در بيماريزايي سرطان پروستات دارد و به دليل نقش كليدي اين مسير در پيشروي سرطان آن را به هدف جذابي براي استراتژي‌هاي جديد درماني تبديل مي‌كند. يكي از روند‌هاي تنظيمي ژن‌ها، ميكروRNAها است كه توانايي ويژه‌اي براي كنترل چندين ژن و مسير به‌طور هم‌زمان، آن‌ها را كانديد قابل توجهي براي اهداف درماني مي‌كند. اين مطالعه با هدف به دست آوردن ميكروRNA موثر بر مسير PI3K/AKT با روش‌هاي بيوانفورماتيكي و بررسي نتايج حاصل در سلول‌هاي رده پروستات انجام شد.
مواد و روش‌ها: براي پيدا كردن ميكروRNA موثر بر مسير PI3K/AKT، شش ژن اين مسير كه به‌عنوان هدف‌هاي دارويي مطرح هستند را در ده الگوريتم متفاوت پيش‌بيني بررسي شد. سپس به‌صورت بيوانفورماتيكي ميكروRNA حاصل از نظر ميزان بيان در بافت پروستات سالم و رده‌هاي سلولي سرطان پروستات و همچنين از لحاظ هدف‌گيري در نرم‌افزارهاي تجزيه و تحليل چرخه ارزيابي شد. به‌صورت عملي بيان ميكروRNAهاي كانديد در نمونه كنترل و رده‌هاي سلولي سرطان پروستات ارزيابي شد.
نتايج: خانواده miR-29 بيشترين شناسايي را از مجموعه 6 ژني داشتند و ساير بررسي‌هاي بيوانفورماتيك نيز مويد نتيجه حاصل بودند. بررسي‌ها نشان دهنده كاهش بيان معني‌دار خانواده miR-29 در رده‌هاي سلولي سرطان پروستات LNCAP، PC3 و DU-145 نسبت به نمونه كنترل سالم است.
نتيجه‌گيري: نتايج مبتني بر تجزيه و تحليلهاي بيوانفورماتيك و بررسي بيان خانواده miR-29، نشان دهنده امكان استفاده از خانواده miR-29 براي مهار مسير PI3K/AKT در سرطان پروستات است.
چكيده لاتين :
Objective: Prostate cancer is the fifth most common cancer. In 2012, it was the second leading cause of cancer death for men worldwide. The PI3K/AKT pathway plays an essential role in pathogenesis of prostate cancer; the key role of this pathway in cancer progression makes it an attractive target for prostate cancer therapy. MicroRNAs (miRNAs) that regulate gene expression have a special ability to simultaneously control multiple genes and pathways which make them candidates for therapeutics. This study aims to determine miRNAs which target the PI3K/AKT pathway and evaluate them in prostate cancer cell lines.
Methods: In order to determine an effective miRNA for the PI3K/AKT pathway, we assessed six genes from this pathway which have been proposed as drug targets in ten different prediction algorithms. Next, the candidate miRNAs were analyzed in expression profile and pathway analysis databases. Expression of candidate miRNAs in control and prostate cancer cell lines were subsequently evaluated.
Results: According to bioinformatics, the miR-29 family could target the most genes from this list. Other bioinformatic estimates confirmed these results. The miR-29 family showed significant downregulation in prostate cancer cell lines LNCAP, PC3 and DU-145 compared to control samples.
Conclusion: These results propose the possibility of using the miR-29 family to inhibit the PI3K/AKT pathway in prostate cancer
عنوان نشريه :
پژوهش هاي آسيب شناسي زيستي
عنوان نشريه :
پژوهش هاي آسيب شناسي زيستي
اطلاعات موجودي :
فصلنامه با شماره پیاپی 0 سال 1393
كلمات كليدي :
#تست#آزمون###امتحان
