شناسايي سرولوژيكي، مولكولي و فيلوژنتيكي ويروس موزائيك زرد كدو مسمايي در استان خراسان رضوي

Serological and Molecular identification of Zucchini yellow mosaic virus in Khorasan Razavi province

در بسیاری از مناطق جهان، ویروس موزائیك زرد كدو باعث كاهش شدید محصول در كدوئیان می‌گردد. در طی بازدیدهای انجام شده طی سال‌های 1389-1388، از مناطق مختلف در استان‌های خراسان رضوی، شمالی و جنوبی، از بین 392 نمونه جمع‌آوری شده، 72 نمونه در آزمون الایزا با آنتی بادی اختصاصی چند همسانه‌ای ویروسZYMV دارای واكنش مثبت بودند. در ادامه تحقیق، دو نمونه مثبت بر اساس دامنة میزبانی و منطقة جغرافیایی برای مطالعات بیش‌تر مورد بررسی قرار گرفتند. این دو جدایه انتخاب شده و ‍ژن پروتئین پوششی (bp970) آن‌ها (cp) از طریق نسخه‌برداری معكوس مبتنی بر واكنش زنجیره‌ای پلیمراز و با كمك آغازگرهای اختصاصی تكثیر ZYMV پس از همسانه سازی، تعیین ترادف گردید. جهت تعیین جایگاه تكاملی دو جدایه ایرانیZYMV مورد بررسی در مقایسه با سایر جدایه‌های ZYMV گزارش شده در دنیا درخت فیلوژنتیكی توسط نرم افزار MEGA4×1 رسم گردید. نتایج حاصله بیانگر آن است كه بر مبنای ترادف نوكلئوتیدی، ناحیه ژن cp جدایه‌های درگز(Da) و نیشابور(Po3) بیش‌ترین تشابه را با جدایه SYZY-30 از كشور سوریه نشان دادند.

Zucchini yellow mosaic virus (ZYMV) causes high yield losses to cucurbits in many parts of the world. During a survey in summer and fall of 2008 and 2009, 392 collected from different fields in Khorasan Razavi, Northern Khorasan and Southern Khorasan provinces were tested based on DAS-ELISA tests using ZYMV specific polyclonal antibody. The result showed that 72 out of 392 samples were infected by ZYMV. Subsequently two ELISA positive samples were selected based on host range and sampling location for further investigation using specific primers for ZYMV coat protein gene. A fragment (970bp) was amplified in reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) using total RNA of plants infected with isolates of ZYMV(P03,Da). Phylogenetic analysis showed that Neyshabour(Po3) and Dargaz (Da) isolate were very close up to 94% identity in cp gene to SYZY-30 isolate from Syria.