شناسايي مولكولي ويروس موزائيك شلغم (Turnip mosaic virus; TuMV) در خردل كاذب (Herschfeldia incana) از ايران

Molecular Identification of Turnip Mosaic virus (TuMV) in Hoary Mustard (Herschfeldia incana) From Iran

ویروس موزائیك شلغم (Turnip mosaic virus; TuMV) یكی از اعضاء مهم جنس Potyvirus در خانواده Potyviridae و یكی از مهم‌ترین ویروس‌های آلوده‌كننده گیاهان خانواده چلیپائیان (Brassicaceae) می‌باشد. در فروردین 1391 علایم یك بیماری مشكوك ویروسی مانند موزائیك، كوتولگی و بدشكلی بوته در علف هرز خردل كاذب مشاهده گردید و وجود ویروس موزائیك شلغم با آزمون RT-PCR و با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ژن پروتئین پوششی (coat protein; CP) این ویروس مورد بررسی قرار گرفت. قطعه تكثیر شده (986 جفت باز) ابتدا خالص‌سازی و سپس تعیین ترادف گردید. آنالیز توالی نوكلئوتیدی وآمینواسیدی پروتئین پوششی، به ترتیب شباهت بین 42/85 تا 58/89 و 64/91 تا 12/95 را با 31 جدایه دیگر این ویروس در دنیا نشان داد. درخت فیلوژنتیكی با نرم‌افزار MEGA6 و روش Neighbour joining ترسیم شد. نتایج این بررسی فیلوژنتیكی نشان داد كه این جدایه ویروس موزائیك شلغم با سه جدایه دیگر از ایران در گروه Basal-B قرار دارند.

Turnip mosaic virus (TuMV) is amember of the Potyvirus genus within the Potyviridae family and is one the most important viruses infecting Brassicaceae plants. In April 2012, suspicious symptoms of a viral disease such as mosaic, stunting and malformation were observed on Herschfeldia incana. The collected samples were tested using reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) with specific primers corresponding to TuMV coat protein gene. Amplified fragment (986bp) was first purified and then directly sequenced. Analysis of its CP nucleotide and amino acid sequence revealed 85.42-89.58 % and 91.64-95.12% similarity to those of 31 TuMV isolates from other countries respectively. Phylogenetic tree was constructed by MEGA6 software using neighbor joining method. The results showed that the TuMV isolate and 3 Iranian isolates have been clustered into the basal-B group.