طراحي تركيبات كرومني جديد با فعاليت ضد سرطاني و بررسي چگونگي ميانكنش آنها با توبولين به روش داكينگ مولكولي

Designing new chromene compounds with anticancer activity and studying their interaction with tubulin by molecular docking method

در حال حاضر روشهاي in silico يكي از كم هزينه ترين و سريع ترين روشهاي موجود جهت طراحي و كشف دارو در زمينه درمان محسوب مي گردد. اين مطالعه بر آن است تا با انجام طراحي محاسباتي دارو به روش داكينگ مولكولي تركيباتي را معرفي كند كه نقش موثري در مهار پلي مريزاسيون توبولين ها به عنوان عوامل اصلي تقسيم سلولي در تومورهاي سرطاني دارند. بدين منظور تركيبات كرومني كه توسط محققين مختلف خواص ضد سرطاني آنها مورد آزمايش قرار گرفته بودند، جمع آوري و بر اساس جايگاه اتصال آنها به توبولين، آنالوگهاي جديدي طراحي شدند. سپس، با استفاده از روش داكينگ مولكولي توسط نرم افزار آكادميك AutoDock Vina تركيبات قويتر شناسايي شدند و برهمكنشهاي احتمالي اين تركيبات با جايگاه اتصال كلشي سين در توبولين آناليز شد. با توجه به اينكه تركيبات طراحي شده با مقدار انرژي پايين تري نسبت به كلشي سين به ساختار پروتيين داك شدند، مي توانند به عنوان تركيبات بالقوه دارويي مورد ارزيابيهاي بعدي قرار بگيرند.

Currently, in silico methods considered as one of the least expensive and fastest ways for drug design and discovery in the field of therapy. In the present study, we were interested to introduce compounds, which have an important role in inhibiting tubulins polymerization as the main factor of cell division in cancerous cells using computational drug design, especially molecular docking method. For this purpose, chromene compounds, which their anticancer properties had been tested by several researchers, were gathered and based on their binding site of tubulin, new analogs were designed. Then, by using AutoDock Vina software, stronger compounds which had the lowest affinity energy, were identified and their possible interaction with the colchinine binding site analyzed by LigPlot and UCSF Chimera. Given that newly designed compounds docked to the protein structure with lower affinity energy than colchicine as the control sample, they could be the subject of further assessment as the potential pharmaceutical compounds.