تنوع آللي ژن كالپاستاتين در گوسفند سنجابي

Allelic Diversity of Calpastatin Gene in Sanjabi Sheep

توليد گوشت ترد كه مطلوب مصرف كنندگان باشد يكي از مسايل مهم در صنعت پرورش گوسفند است. لذا، مطالعه سازكارهاي بيوشيميايي تجزيه ماهيچه در سطح مولكولي ضروري است. كالپاستاتين يك مهار كننده داخلي است و نقش اصلي را در تنظيم فعاليت كالپاين در سلولها ايفا مي كند. گوسفند سنجابي يك حيوان مهم توليد كننده گوشت در استان كرمانشاه است كه با نشانگرهاي مولكولي، به ويژه از نظر ژن كالپاستاتين مورد مطالعه قرار نگرفته است. بنابراين، هدف اين تحقيق تعيين تنوع ژنتيكي گوسفندان سنجابي از نظر ژن كالپاستاتين و مقايسه اين نژاد با نژادهاي ديگر بود. براي انجام اين مطالعه يك قطعه 622 جفت بازي از اين ژن از روي 142 نمونه DNA گوسفند سنجابي با واكنش زنجيره اي پليمراز (PCR) تكثير شد. محصولات PCR با روش RFLP و با استفاده از دو آنزيم MspI و NcoI هضم و سه ژنوتيپ MM، MN و NN مشاهده شدند. فراواني ژنوتيپهاي MM، MN و NN به ترتيب 67/0، 25/0 و 08/0، فراواني ژنهاي M و N به ترتيب 79/0 و 21/0 و ميانگين شاخصهاي شانون و نيي به ترتيب 51/0 و 33/0 به دست آمد و جمعيت براي اين جايگاه در تعادل هاردي-وينبرگ قرار نداشت. نتايج اين آزمايش نشان داد كه اين جمعيت چند شكلي بالايي دارد، به علاوه در بيشتر نژادهاي گوسفند ايراني مطالعه شده هر سه ژنوتيپ مشاهده نشدند ولي در اين نژاد هر سه ژنوتيپ وجود داشت.

Producing tender meat that consumerʹs desire is one of the major problems facing the sheep industry. Therefore, study of the biochemical mechanisms for muscle degradation is essential at the molecular level. Calpastatin is an endogenous inhibitor and plays an essential role in regulation of calpain activity in cells. Sanjabi sheep is an important animal producing meat in Kermanshah province that until now has not been studied by DNA markers, especially in the case of calpastatin gene. Therefore, present study was conducted to determine the genetic diversity of calpastatin gene in Sanjabi sheep and to compare this breed with other sheep breeds. A 622 bp fragment from this gene was amplified by polymerase chain reaction (PCR) from DNA samples of 142 Sanjabi sheep. PCR products were characterized by the restriction fragment length polymorphism (RFLP) method using two restriction enzymes, MspI, and NcoI, yielding 3 genotypes, MM, MN and NN. Genotype frequencies of MM, MN and NN were 0.67, 0.25 and 0.08, respectively. Gene frequencies of M and N were 0.79 and 0.21, respectively and mean of Neiʹs and Shanonʹs indexes were 0.51 and 0.33, respectively. Population was not in Hardy-Weinberg equilibrium for this locus. The results of this experiment indicated that this population is highly polymorphic. Furthermore, in the most studied Iranian sheep breeds, all 3 genotypes of this gene have not been detected whereas in this breed all 3 genotypes were observed.