شناسايي ژن هاي تنظيم كننده سيستم ايمني با استفاده از داده هاي RNA - Seq لوكوسيت گاو

بررسي شبكه هاي ژني از جمله مطالعاتي است كه بر روي داده هاي توالي يابي رونوشت سلولي انجام مي شود. مطالعه حاضر با بررسي شبكه ژني داده هاي رونوشت سلول هاي لوكوسيت گاوي، سعي بر شناسايي ژن هاي م‍وثر بر سيستم ايمني و فعاليت سلول هاي لوكوسيت دارد. در اين مطالعه پس از شناسايي ژن ها و ايزوفرم هاي مختلف و اندازه گيري سطح بيان آن ها، شبكه ژني با بسته آماري GeneNet كه مرتبط با نرم افزار R مي باشد، مورد مطالعه قرار گرفت. ژن هايي كه به عنوان تنظيم كننده در اين شبكه ي ژني به آن ها پرداخته شده است غالباً بر فرآيندهاي مختلفي نظير مسيرهاي سيگنال دهي مرتبط با فعاليت لوكوسيت ها، نابودي سلولي و عفونت ها، پلاريزه شدن ماكروفاژ، مهاجرت لوكوسيت ها و كموتاكسيس و فاگوسيتوز در نوتروفيل ها موثرند. با وجود اين كه عملكرد تعدادي از اين ژن ها هنوز به خوبي شناسايي نشده است ولي با توجه به نقش اصلي اين ژن ها در شبكه ژني، احتمال مي رود با بررسي پلي مورفيسم اين ژن ها و ارتباط آلل هاي مختلف آنان با پاسخ هاي ايمني، بهترين آلل ها شناسايي شده و در انتخاب دام ها به كمك ژن ها، طراحي ريز آرايه و انتخاب ژنومي از آن ها استفاده شود.