استخراج مستقيم و خالص سازي DNA كل از جامعه ميكروبي خاك و رديابي مولكولي فرم هاي اختصاصي بيمارگر خاكزاد Fusarium oxysporum عامل پژمردگي آوندي گوجه فرنگي

دستيابي به اطلاعات مولكولي و ژنتيكي توانسته است بسياري از چالش هاي علوم زيستي را در جنبه هاي مختلف حل كند. روش هاي كاربردي بسياري جهت استخراج DNA از بافت هاي جانوري و گياهي و ساير موجودات زنده شناسايي و معرفي شده است.، در بسياري مطالعات ژنتيكي در جوامع ميكروبي، اغلب نياز به استخراج مستقيم DNA از خاك است. در اين تحقيق پس از مطالعه دقيق روش هاي مختلف پيشنهادي، سه روش (شيميايي- آنزيمي)، (شيميايي- مكانيكي) و (شيميايي- آنزيمي- مكانيكي)، جهت استخراج DNA ازجامعه ميكروبي خاك، جداگانه طرح و مورد مطالعه و بررسي قرار گرفت تا مناسب ترين روش، شناسايي و معرفي شود. مقايسه بين روش هاي مختلف در شرايط برابر و 5 تكرار براي هر روش، در محصول DNA اختلاف مشخصي را از ميانگين غلظت32/2 تا 1/6 نانوگرم بر ميكروليتر DNA رقيق شده، نشان داد و همچنين بر اساس اطلاعات بدست آمده از دستگاه نانودراپ و الكتروفورز و بررسي نسبت DNA به پروتئين در محصول استخراج DNA، روش (شيميايي- آنزيمي-مكانيكي) با كارايي بهتر در غلظت بيشتر، حذف هيوميك اسيد، پروتئين و ساير آلودگي ها به ساير روش ها برتري داشت. در اين تحقيق همچنين رديابي مولكولي بيمارگر ها به عنوان يكي از كاربردهاي مهم استخراج مطرح و فرم اختصاصي Fusarium oxysporum f. sp lycopersici و Fusarium oxysporum f. sp. radicis lycopersici عامل پژمردگي آوندي در گوجهفرنگي از جامعه ميكروبي خاك به وسيله تكنيك هاي مولكولي با آغازگر اختصاصي uni شناسايي شد. نتايج رديابي مولكولي، حضور فرم هاي اختصاصي اين بيمارگر را در نمونه خاك S1 با 5 تكرار تائيد مي نمايد.