شناسايي و جداسازي ژن VvDREB و ارتولوگ ژن SbDREB2A از انگور عسكري تحت تنش شوري

عامل نسخه برداري DREB (پروتئين متصل شونده به عنصر پاسخ دهنده به كم آبي) يكي از چهار سيستم تنظيمي مستقل در گياهان است كه در فعال شدن ژن هاي پاسخ دهنده به تنش هاي محيطي نقش دارد. به منظور شناسايي و جداسازي برخي از ژن هاي DREB در انگور، گياهان تحت تنش 150 ميلي مولار NaCl قرار گرفته و سپس RNA كل استخراج شد. آغازگرهاي اختصاصي براساس ژن فرضي DREB و همولوگ ژن SbDREB2A گياه نمك دوست Salicornia brachiata با انگور طراحي و ژن هاي VvDREB و DREB like 2C (ارتولوگ SbDREB) از انگور جدا شد. نتايج نشان داد كه ژن VvDREB با ژن هاي DREB گروه دو خانواده سويا در حدود 85 درصد و دو ژن SbDREB2Aو DREB like 2C درحدود 80 درصد شباهت دارد. رسم ساختار ثانويه پروتيين VvDREB و پروتيين هاي DREB2 سويا نشان داد كه در ناحيه حفاظت شده AP2 آن ها ساختارHelix مشابه وجود دارد. مطالعه و مقايسه موتيف هاي پروتئين VvsDREB وSbDREB2A در سايت ELM حاكي از عدم وجود پنج موتيف متفاوت (BRCT، MAPK، PKB، NES، NLS) در پروتئين VvsDREB بود كه احتمال مي رود دليل بر ناكارايي موثر عملكرد آن باشد.