شناسايي جايگاه هاي رتروترنسپوزوني (IRAP) مرتبط با مقاومت به بيماري پوسيدگي اسكلروتينيايي ساقه (.Sclerotinia spp) در آفتابگردان

Identification of retrotransposon-based (IRAP) loci associated with resistance to Sclerotinia stem rot disease (Sclerotinia spp.) in sunflower

بيماري اسكلروتينيا از بيماري هاي قارچي مهم آفتابگردان در ايران مي باشد كه باعث كاهش رشد و عملكرد محصول مي شود. در پژوهش حاضر واكنش 100 لاين آفتابگردان روغني به 6 جدايه قارچ اسكلروتينيا مورد بررسي قرار گرفت و سپس به منظور شناسايي مكان هاي ژني دخيل در مقاومت به بيماري از 128 جايگاه ژنومي تكثير شده توسط آغازگرهاي رتروترنسپوزوني IRAP استفاده شد. نتايج نشان داد كه تنوع بالايي در ژر م پلاسم مورد مطالعه براي مقاومت به بيماري پوسيدگي اسكلروتينيايي ساقه وجود دارد. بررسي ساختار جمعيت، لاين هاي مورد مطالعه را به 3 زيرجمعيت احتمالي (3=K) تقسيم نمود. در تجزيه ارتباط با دو مدل GLM و MLM به ترتيب 14 و 11 مكان ژنومي پيوسته با مقاومت به بيماري (P?0.01) شناسايي شد. نشانگرهايLTR 1063-65 ،LTR 1064-65 وLTR 1062 با ژن هاي كنترل كننده مقاومت به چندين جدايه قارچ عامل بيماري پيوسته بودند. نشانگرهاي مشترك به دليل تسهيل گزينش همزمان براي ايجاد مقاومت به چندين جدايه قارچي، مي توانند در برنامه هاي به نژادي آفتابگردان نظير انتخاب به كمك نشانگر (MAS) بخوبي استفاده شوند.

Sclerotinia disease is important fungal disease of sunflower in Iran that reduces its growth and yield. In this study, reactions of 100 oily sunflower lines to 6 fungal isolates of Sclerotinia were studied and then 128 retrotransposon-based molecular markers (IRAP) were used to identify genes controlling disease resistance. The results showed that there is high diversity in the studied germplasm for resistance to the Sclerotinia stem rot. Population structure analysis subdivided the studied lines into 3 subpopulations (K=3). Association analysis with general and mixed linear models (GLM and MLM) identified 14 and 11 loci, respectively that are significantly associated (P?0.01) with Sclerotinia disease resistant genes. Markers LTR 1063-65, LTR 1064-65 and LTR 1062 were commonly associated with resistant to some fungal isolates. The common markers due to facilitating simultaneous selection for resistance to several fungal isolates can be well used in sunflower breeding programs like marker-assisted selection (MAS).