گروه‌بندي ژنتيكي گاوميش هاي بومي آذري و شمالي با روش شبكه عصبي SVM

هدف اين تحقيق گروه بندي گاوميش هاي استان­هاي آذربايجان شرقي، غربي و اردبيل از بوم جور (اكوتيپ) آذري و استان گيلان از بوم جور شمالي و درنهايت قابليت جداسازي افراد مناطق مختلف با روش يادگيري ماشين بود. به شمار 258 گاوميش از مناطق مختلف دو بوم جور شمالي و آذري نمونه گيري شد و با استفاده از SNPChip 90K مربوط به شركت افي متريكس در كشور ايتاليا تعيين ژنوتيپ شد. براي پيش بيني عملكرد روش ماشين بردار پشتيبان براي گروه بندي افراد، دو روش متريك اعتبارسنجي متقابل و سطح زير منحني مشخصه عملكرد سامانه (AUC) اعمال شد. نتايج آزمون اعتبارسنجي متقابل و سطح زير منحني براي گروه بندي افراد چهار منطقه به ترتيب 92 و 96 درصد بود كه گوياي اين است كه باوجود نزديك بودن افراد گله هاي مختلف و سخت بودن جداسازي اين افراد، روش ماشين بردار پشتيبان با درستي بالايي، توانايي اختصاص دادن افراد به گله­هاي مربوط به خود را دارد. نتايج آزمون­هاي اعتبارسنجي متقابل و سطح زير منحني مشخصه عملكرد سامانه براي دو بوم جور به ترتيب برابر 96 و 98 درصد بود كه نشان دهنده قابليت جداسازي بهتر دو بوم جور است. روش يادگيري ماشين با توجه به اين موارد و با پيش بيني هايي كه براي گروه بندي هر فرد انجام مي­دهد مي­تواند در كنترل كيفيت و كاربردهاي ژنتيكي كارآمد باشد.