تعيين گروه‌هاي فيلوژنتيك و مقاومت آنتي‌بيوتيكي در ايزوله‌هاي اشريشياكلي اوروپاتوژنيك و كامنسال جدا شده از شهر زنجان

Determination of Phylogenetic Groups and Antibiotic Resistance in Uropathogenic and Commensal Escherichia Coli Isolated from Patients in Zanjan City

زمينه و هدف: سويه هاي اشريشياكلي عامل اصلي عفونت مجاري ادراري (UTI) بوده كه به گروه بزرگي از اشريشياكلي هاي بيماريزاي خارج رودهاي تعلق دارند. اين باكتريها به چهار گروه اصلي فيلوژنتيك B2, B1 ,A و D تقسيم ميشوند. هدف از مطالعه ي حاضرتعيين گروه هاي فيلوژنتيك در اشريشياكلي اوروپاتوژنيك و كامنسال بود و با توجه به افزايش مصرف آنتي بيوتيك ها و افزايش مقاومت دارويي، ارزيابي الگوي مقاومت آنتي بيوتيكي سويه هاي اشريشياكلي و اروپاتوژن جداسازي شده از بيماران مشكوك به عفونت ادراري نيز انجام گرفت. روش بررسي: در اين مطالعه ي مقطعي توصيفي 137 ايزوله ي اشريشياكلي اوروپاتوژن از بيماران مشكوك به عفونت ادراري از بيمارستان هاي زنجان و 50 ايزوله از نمونه هاي مدفوع بالغين سالم جمع آوري شد. بعد از تاييد ايزوله ها با روش هاي بيوشيميايي و استخراج DNA كل، PCR توسط پرايمرهاي اختصاصي براي گروه بندي فيلوژنتيك انجام گرفت. حساسيت آنتيميكروبي ايزوله هاي تاييد شده اشريشياكلي اوروپاتوژن (باروش ديسك ديفيوژن)، طبق دستورالعمل CLSIدربرابر با سيزده آنتي بيوتيك انجام گرفت. يافته ها: براساس نتايج به دست آمده از تست مقاومت آنتي بيوتيكي بيشترين ميزان مقاومت به ترتيب مربوط به آمپي سيلين (5/74 درصد) و آزترئونام (1/59 درصد) بود، همچنين كمترين ميزان مقاومت دربرابر ايميپنم (5/1 درصد) و آميكاسين (9/10 درصد) گزارش شد. ارزيابي PCR گروه هاي فيلوژنتيك سويه هاي اشريشياكلي اوروپاتوژنيك نشان داد كه بيشترين ميزان فراواني مربوط به گروه B2 (15/67درصد) سپسD (17/21 درصد) و A (68/11 درصد) بود و گروه فيلوژنتيك B1 در ايزوله هاي اوروپاتوژنيك مشاهده نشد. در ايزوله هاي اشريشياكلي كامنسال فراواني گروه ها به ترتيب مربوط به D 52 درصد، B2 24 درصد، A 14 درصد و B1 10درصد بود. نتيجه گيري: نتايج حاصله نشان داد كه درصد فراواني گروه هاي فيلوژنتيكي B2 و D در ايزوله هاي اشريشياكلي اوروپاتوژنيك و كامنسال مورد مطالعه بالا بوده است.

Background and Objective: Escherichia coli strains are the major cause of urinary tract infections which belong to the large group of extraintestinal pathogenic E. coli. They fall into four main phylogenetic groups: A, B1, B2 and D. The aim of the present study was to determine phylogenetic groups in uropathogenic and commensal Escherichia coli isolated. Also, due to increase in the rate of antibiotic usage and subsequent drug resistance, this study evaluated the antimicrobial resistance pattern of E. coli isolated from patients with UTI. Materials and Methods: In this crosssectional study, 137 uropathogenic Escherichia coli isolates were collected from the clinical specimens of Zanjan hospitals and 50 isolates were collected from healthy adults. After verifying isolates via biochemical methods and extraction of total DNA, Multiplex PCR was done by specific primers for phylogenetic grouping. The antibiotic susceptibility test (disk diffusion method) was done according to CLSI advice against 13 antibiotics. Results: In this study, the highest rates of resistance to antibiotics in UTI isolates were seen against ampicillin (74.5%) and aztreonam (59.1%). Also, the lowest rates of resistance were reported against imipenem (1.5%) and amikacin (10.9%).The distribution of UPEC phy logenetic groups typing marked the highest prevalence in group B2 (67.15 %) , and then in group D (21.17%) and the lowest prevalence in group A (11.68%). Phy logenetic B1 was not observed in uropathogenic isolates. Among the commensal isolates, 52% belonged to phylogenetic group D, 24% to B2, 14% to A, and10% to B1. Conclusion: The results indicate the higher prevalence of B2 and D phylogenetic groups in commensal and uropathogenic Escherichia coli strains in Zanjan.