تنوع ژنتيكي ژنوتيپ‌هاي جو (vulgare Hordeum) با استفاده از نشانگرهاي ريزماهواره و تجزيه ارتباط صفات وابسته به سازگاري به خشكي

Genetic Diversity of Barley (Hordeum vulgare) Genotypes Using Microsatellite Markers and Association Analysis of Traits Related to Drought Compatibility

اين مطالعه به منظور بررسي تنوع ژنتيكي و گروه بندي 52 ژنوتيپ جو زراعت ديم متعلق به كشورهاي مصر، ايران و چين (تهيه شده از مؤسسه تحقيقات كشاورزي ديم، مراغه) با استفاده از نشانگرهاي ريزماهواره انجام شد. پس از استخراج DNA از برگ هاي جوان، محصولات تكثيري با استفاده از 59 جفت آغازگر ريزماهواره روي ژل الكتروفورز واسرشته ساز پلي آكريلاميد 5/4% تفكيك شدند. در كل از 40 جفت آغازگر ريزماهواره داراي تكثير مناسب 134 الل چندشكل، با ميانگين 4/3 الل به ازاي هر نشانگر شناسايي شد و متوسط PIC براي كليه نشانگرها 47/0 محاسبه شد. براساس نتايج، نشانگرهاي ريزماهواره چندشكلي بالايي در ژنوتيپ هاي جو نشان دادند. در تجزيه خوشه اي به روش UPGMA ژنوتيپ ها به دو گروه اصلي طبقه بندي و ژنوتيپ هاي دو رديفه و شش رديفه تا حد زيادي از هم تفكيك شدند. تنوع ژنتيكي مطلوبي در درون و بين گروه ها وجود داشت. براساس تجزيه ارتباط، 18 نشانگر مثبت سازگاري به خشكي شناسايي شد كه در صورت تاييد در ساير آزمايش ها قابل استفاده در برنامه هاي به نژادي هستند. اين نشانگرها مي توانند به طور موثر براي ارزيابي تنوع ژنتيكي و گروه بندي ژرم پلاسم جو مورد استفاده قرار گيرند.

This study was conducted to investigate the genetic diversity and classification of 52 barley genotypes from Egypt, Iran and China (obtained from Dryland Agricultural Research Institute, Maragheh) using microsatellite markers. DNA was extracted from young barley leaves and amplified PCR products were separated on 4.5% polyacrylamide denaturing gel electrophoresis using 59 microsatellite primer pairs. From 40 microsatellite primer pairs with good amplification, 134 polymorphic alleles were identified with average alleles of 3.4 per marker and the PIC average for all of the markers was calculated 0.47. Based on the results, microsatellite markers showed high polymorphisms in barley genotypes. In cluster analysis based on UPGMA method, genotypes were classified into two main groups and tworowed and sixrowed genotypes were diverged mostly from each other. Desirable genetic diversity was also detected within and between groups. Based on association analysis, 18 informative markers for drought compatibility were identified, which after confirmation in other tests could be used in breeding programs. In addition, these markers can be used efficiently for assessment of genetic diversity and classification of barley germplasm.