آناليز فيلوژنيك بخشي از ژن پروتيين هماگلوتينين سه ويروس آنفلوانزاي پرندگان H9N2 جدا شده از گله هاي طيور گوشتي اهواز بين سال هاي 1390 تا 1392

Phylogenetic characterization of the partial hemagglutinin protein genes of three avian influenza viruses (H9N2) isolated in Ahvaz broiler flocks during 2011-2013

صنعت طيور كشور ايران از سال ???? درگير بيماري آنفلوانزاي پرندگان مي باشد. بروز بيماري با تلفات بالا اين تصور را ايجاد كرده است كه ويروس آنفلوانزا در سطح مزرعه دچار تغييرات ژنتيكي شده است. در اين مطالعه سه ويروس آنفلوانزاي طيور (H9N2) جدا شده از گله هاي آلوده با تلفات بالا مورد شناسايي ملكولي قرار گرفتند. قطعه 488 جفت باز در اين ويروس ها كه در بر گيرنده ي بخش مياني ژنوم پروتيين هماگلوتينين بود به روش RT-PCR تكثير و سپس تعيين توالي نوكليوتيد انجام گرفت. آناليز نوكليوتيدها و اسيدهاي آمينه نشان دهنده ي وجود سه ويروس بسيار شبيه به يكديگر ولي متمايز از همديگر بود. آناليز فيلوژني قطعه ?88 جفت باز محصولات گزارش شده از ساير نقاط جهان نشان داد، ويروس هاي آنفلوانزاي طيور ايران رابطه ي بسيار نزديكي با يكديگر داشته و به احتمال فراوان داراي منشا يكسانند. بيشترين شباهت اسيدهاي آمينه اين ويروس ها به ترتيب با ويروس هاي آنفلوانزاي طيور كشور هند (99 و 97 درصد)، تونس (99 درصد) بود. نتايج اين مطالعه نشان داد كه ويروس هاي آنفلوانزاي طيور ايران شبيه ويروس هاي غير بيماريزاي H9N2 از دودمان اوراسيايي بوده و تغييرات ژنتيكي در ژن هماگلوتينين موجب به وجود آمدن پاتوتيپ جديد نشده است.

Since 1998, Iranian poultry industry has been affected by avian influenza (AI) virus,subtype H9N2. The association of high mortality with these outbreaks in the field raised the specter of a possible new genetic modified AI virus. In this study, three AI viruses (H9N2) isolated from the broiler flocks with high mortality rates were characterized. The 488bp PCR products containing the midle site of hemagglutinin (HA) protein were generated and sequenced to determine molecular characterization of the isolates. Sequence analysis of main region of HAl gene of three isolates showed that isolates were identical at the nucleotide as well as amino acid levels. Phylogenetic analysis of 488 bp nucleotide region of the PCR products revealed that Iranian AI viruses had very close relationship to each other indicating these came from the common source. Moreover, the maximum amino acid sequence similarity of these viruses was observed with AI viruses from India (99 & 97%), Tunisia (99%), respectively. Overall, the results indicate that the current status of Iranian AI viruses resembles to other Eurasian H9N2 viruses and in spite of different nucleotide sequences among the viruses there is no evidence for existence of new AI pathotype.