احتمال نقش تنظيمي miR-146a بر ژن‌هاي دخيل در مسيرهاي داخل سلولي سرطان معده القا شده توسط هليكوباكتر پيلوري بر اساس يافته‌هاي بيوانفورماتيكي

In silico studies revealed a crucial role for miR-146a on progression of Helicobacter pylori induced gastric cancer

چكيده سابقه و هدف سرطان معده چهارمين سرطان شايع دنيا و دومين عامل مرگ‌ و مير محسوب مي‌شود. عوامل محيطي و هم چنين عوامل ژنتيكي، نقش به سزايي در ابتلا و پيشرفت اين بيماري ايفا مي كنند. مهم‌ترين اين عوامل هليكوباكتر پيلوري است كه در اكثر بافت هاي سرطاني قابل‌رويت است. با ورود ميكرو RNA ها به حوزه يافته هاي ژنتيكي، اين مولكول هاي قدرتمند جايگاه خود را در حوزه ژنتيك بيماري ها باز كردند. miRNAها، مولكول هاي كوچك غيركدكننده اي هستند كه در پروسه‌هاي متعدد سلولي از قبيل تمايز و مرگ سلولي شركت دارند. در اين مطالعه، با استفاده از پايگاه داده هاي بيوانفورماتيك ژن هاي دخيل در مسيرهاي سيگنالينگ سلولي موثر در فرآيند سرطاني شدن سلول ها و ارتباط آن با miR-146a بررسي‌شده است. مواد و روش‌ها اين مطالعه از نوع تيوريكال بيوانفورماتيكي بوده و به ‌صورت نظري با مراجعه به پايگاه داده Target Scan ، miRTar Base و 0/2 miR Walk انجام پذيرفت. پس از به دست آوردن پروتيين هايي كه تحت تاثير miR-146a قرار مي گيرند، بررسي نهايي در پايگاه David به‌منظور دست‌يابي به مسيرهاي سيگنالينگ انجام گرفت كه به‌تفصيل به شرح آن پرداخته مي‌شود. يافته‌ها بر اساس نتايج به ‌دست ‌آمده، miR-146a احتمالاً مي تواند با تاثير بر پروتيين هايي از قبيل P53 ، BCL2 ، اعضاي خانواده RASو پروتيين هاي دخيل در مسير JAK-STAT ، miRNA كليدي در جلوگيري از پيشرفت بيماري باشد. نتيجه گيري با توجه به اين نتايج مي توان گفت miR-146a احتمالاً مي تواند از طريق افزايش متاستاز و حمله بافتي و هم چنين كاهش چسبندگي بين سلولي و مهار مرگ سلولي، به‌ عنوان ماركر تاييدي تشخيصي و پيش‌آگهي‌دهنده پيشرفت سرطان مورد استفاده قرار گيرد.

Abstract Background and Objectives Stomach cancer is currently ranked as the fourth most common cancer and the second regarding to the mortality rate. Environmental and genetic factors both play crucial role in the onset of inflammation in the stomach and progression of the cancer. In a majority of gastric cancer cases, Helicobacter Pylori infection is a responsible factor. Nowadays, the micro RNAs are pinpointed as the powerful molecules in the field of disease genetics. In the present study by implementing several bioinformatics database, we have undertaken a research on the association of miR-146a with the expression of the genes involved in cell signaling pathways in gastric cancer development. Materials and Methods This type of study was theoretical bioinformatics. The first step to candidate the most important miRNAs is to collect data from the previous studies; then, miRWalk 2.0 and miRTarBase databases were chosen for primary studies. The final review was made at David database in order to achieve pathways involved in gastric cancer. Results Based on the results from this study, miR-146a was predicated as a key factor in preventing the cancer progression by affecting an increase on metastasis and tissue attack and preventing apoptotic pathways. Conclusions Data revealed that the expression of miR-146a increased the progress of gastric cancer. Thus, the analysis of the miR-146a expression could be accounted as a valuable marker for prognosis of gastric cancer.