بررسي ساختار تنوع ژنتيكي جمعيت‌هاي نياي وحشي گندم (Aegilops crassa) با استفاده از نشانگرهاي بين ريزماهواره ژنومي

Genetic diversity structure of Aegilops crassa accessions revealed by genomic ISSR markers

به‌منظور بررسی تنوع ژنتیكی 16 جمعیت از گونه Aegilops crassa با استفاده از 10 آغازگر ISSR، در مجموع 105 آلل تكثیر شدند كه از این تعداد، 86 آلل (90/81 درصد) به‌عنوان آلل چندشكل تشخیص داده شدند. تعداد آلل‌‌های تكثیر شده از 6 تا 15 با میانگین 11 آلل متغیر بود. محتوای اطلاعات چندشكلی از 17/0 در آغازگر UBC842 تا 34/0 برای آغازگر ISSR12 متفاوت بود. همچنین شاخص نشانگر از 98/0 برای آغازگر UBC842 تا 7/2 برای آغازگر ISSR08 متفاوت بود. میانگین شباهت ژنتیكی محاسبه شده برای اطلاعات نشانگرهای بین ریزماهواره‏ای برابر 89/0 بود و از 76/0 (بین دو ژنوتیپ از كرمانشاه و تبریز) تا 96/0 (بین دو ژنوتیپ از ایلام و كرمانشاه) متفاوت بود. تجزیه خوشه­ای بر اساس داده­های مولكولی، ژنوتیپ­ها را در سه گروه جداگانه قرار داد كه به‌وسیله تجزیه واریانس مولكولی تأیید شد. البته روش‌های گروه‏بندی خوشه‌ای و تجزیه به مختصات اصلی نتوانست جمعیت‌ها را به‌طور كامل از هم تفكیك كند و عدم ارتباط بین تنوع مولكولی و تنوع جغرافیایی را نشان داد كه نشان‌دهنده تنوع ژنتیكی بالای این جمعیت‌ها می‌باشد. تجزیه واریانس مولكولی نشان داد كه سطح بیشتری از تنوع به درون جمعیت‌ها (53‌‌ درصد) تعلق داشت، درحالی‌كه (47‌ درصد) تنوع در بین جمعیت‌ها مشاهده شد.

Genetic diversity among 16 accessions of Aegilops crassa was investigated using 10 ISSR primers. Totally, 105 alleles were amplified and 86 alleles (81.90%), were polymorphic. Number of amplified alleles ranged from 6 to 15 with average number of 11 alleles for each primer. Polymorphic information content (PIC) varied from 0.17 (primer UBC 842) to 0.34 (primer ISSR12). Marker index criterion ranged from 0.98 (primer UBC842) to 2.7 (primer ISSR08). Cluster and principal coordinate analysis could not completely separate accessions and showed no association between molecular diversity and geographic diversity of the genotypes, indicating that there is high genetic diversity among the accessions. Mean genetic similarity between microsatellite marker information was 0.89 ranged from 0.76 (between two genotypes from Kermanshah and Tabriz) to 0.96 (between two genotypes of Ilam and Kermanshah). Based on analysis of molecular variance, a larger proportion of genetic variation (53%) belonged to within populations, while a small proportion (47%) observed among the studied populations.